More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1148 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1148  NusG antitermination factor  100 
 
 		 207 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000795097  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  51.15 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  51.15 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  49.13 
 
 		 174 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  48.26 
 
 		 177 aa  177  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  47.13 
 
 		 172 aa  174  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  44.44 
 
 		 175 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  45.93 
 
 		 175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  47.16 
 
 		 181 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  44.71 
 
 		 177 aa  158  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  44.77 
 
 		 175 aa  158  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  44.71 
 
 		 177 aa  158  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  44.71 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  44.38 
 
 		 172 aa  154  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  42.69 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  40.43 
 
 		 194 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  41.05 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  41.21 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  43.27 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  42.44 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  42.13 
 
 		 176 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  46.86 
 
 		 175 aa  148  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  42.77 
 
 		 179 aa  148  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  42.11 
 
 		 184 aa  148  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  46.59 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  42.44 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  43.93 
 
 		 177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  41.48 
 
 		 182 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  44.51 
 
 		 175 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  41.48 
 
 		 182 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  40.11 
 
 		 176 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  38.02 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  41.48 
 
 		 178 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  40.91 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  40.7 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  41.62 
 
 		 174 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  36.24 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  41.81 
 
 		 181 aa  141  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  43.68 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  35.65 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  37.37 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  37.11 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  38.6 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  38.64 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  36.49 
 
 		 306 aa  137  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  35.93 
 
 		 266 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  39.2 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  39.43 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  38.42 
 
 		 176 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  39.43 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  37.29 
 
 		 176 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  41.57 
 
 		 185 aa  134  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  37.97 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  35.42 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  38.15 
 
 		 176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1492  NusG antitermination factor  39.89 
 
 		 178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.509367  normal  0.372591 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  37.57 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  38.15 
 
 		 177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  36.72 
 
 		 176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  36.72 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  36.72 
 
 		 176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  33.77 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  38.29 
 
 		 176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  33.77 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  36.52 
 
 		 266 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  40 
 
 		 176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  37.76 
 
 		 273 aa  131  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  35.6 
 
 		 271 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  131  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 185 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  39.89 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  37.14 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  36.57 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  35.6 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  38.24 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  37.43 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  36.16 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 		 177 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  36.87 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  35.6 
 
 		 317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  37.5 
 
 		 176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  35.09 
 
 		 173 aa  128  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  37.5 
 
 		 176 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  35.43 
 
 		 185 aa  128  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>