More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1141 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 
426 aa  846  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  4.40606e-06  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  64.43 
 
 
426 aa  566  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  58.8 
 
 
427 aa  526  1e-148  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  3.95879e-05 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  59.49 
 
 
426 aa  499  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  7.50325e-06 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  45.78 
 
 
437 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  46.06 
 
 
438 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  47.7 
 
 
439 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  47.13 
 
 
436 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  45.64 
 
 
441 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  45.58 
 
 
438 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  45.27 
 
 
441 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  45.96 
 
 
423 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  46.45 
 
 
429 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  46.14 
 
 
435 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  45.27 
 
 
441 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  46.47 
 
 
435 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  45.31 
 
 
441 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 
441 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 
441 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  46.19 
 
 
430 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  44.5 
 
 
432 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  45.66 
 
 
436 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  45.23 
 
 
445 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 
441 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.34 
 
 
429 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 
436 aa  365  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  46.33 
 
 
447 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  46.33 
 
 
447 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  44.87 
 
 
435 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  8.11889e-07 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  44.97 
 
 
445 aa  364  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  44.6 
 
 
437 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  45.5 
 
 
430 aa  362  5e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  45.64 
 
 
447 aa  362  5e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  43.69 
 
 
431 aa  361  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  45.37 
 
 
429 aa  360  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  46.42 
 
 
445 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 
435 aa  360  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  43.64 
 
 
436 aa  360  4e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  43.96 
 
 
437 aa  359  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  45.58 
 
 
443 aa  359  6e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 
435 aa  359  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  45.58 
 
 
443 aa  359  6e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  2.66535e-11 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.12 
 
 
428 aa  358  7e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 
437 aa  358  8e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  45.45 
 
 
445 aa  358  9e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  42.95 
 
 
446 aa  357  2e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  44.34 
 
 
438 aa  357  3e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  43.45 
 
 
443 aa  357  3e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  46.61 
 
 
435 aa  356  4e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 
442 aa  356  4e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  46.58 
 
 
457 aa  356  4e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  43.28 
 
 
435 aa  355  7e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.67 
 
 
439 aa  355  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.16 
 
 
442 aa  354  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.52006e-07  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  44.34 
 
 
437 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  43.21 
 
 
443 aa  354  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  45.01 
 
 
436 aa  354  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  44.49 
 
 
448 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 
435 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02472e-07 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.55 
 
 
434 aa  353  5e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  44.47 
 
 
419 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  42.07 
 
 
443 aa  350  3e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  44.57 
 
 
441 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  7.25785e-06  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  43.64 
 
 
448 aa  347  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.68 
 
 
463 aa  345  7e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 
437 aa  345  8e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  44.27 
 
 
420 aa  345  8e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  44.34 
 
 
418 aa  345  9e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  43.16 
 
 
435 aa  344  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  42.3 
 
 
443 aa  343  3e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  2.11329e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  43.87 
 
 
444 aa  343  3e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  43.87 
 
 
444 aa  343  3e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  42.6 
 
 
432 aa  343  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  43.6 
 
 
440 aa  343  5e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  43.06 
 
 
444 aa  342  6e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  44.65 
 
 
435 aa  342  7e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  44.1 
 
 
442 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  44.1 
 
 
442 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  44.11 
 
 
443 aa  341  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  43.4 
 
 
442 aa  340  3e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  8.98122e-06  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  43.21 
 
 
441 aa  340  3e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  44.19 
 
 
437 aa  340  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  44.34 
 
 
431 aa  339  5e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  43.16 
 
 
453 aa  339  6e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  43.4 
 
 
443 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  43.4 
 
 
443 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  43.56 
 
 
441 aa  338  7e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  43.26 
 
 
437 aa  337  2e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  43.4 
 
 
443 aa  338  2e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  4.33507e-06 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  44.24 
 
 
445 aa  337  2e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  43.95 
 
 
446 aa  338  2e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  43.4 
 
 
443 aa  337  2e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  42.53 
 
 
443 aa  337  3e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  42.22 
 
 
442 aa  336  4e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  40.51 
 
 
444 aa  335  6e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  43.91 
 
 
449 aa  335  7e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  43.72 
 
 
448 aa  335  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  43.65 
 
 
443 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  44.1 
 
 
444 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  4.20552e-06 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  41.67 
 
 
448 aa  333  3e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>