127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0493 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 92 aa  177  4.999999999999999e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  41.03 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  43.21 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  47.06 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  37.66 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  38.67 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  40.48 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  39.53 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  49.32 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  39.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  39.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  39.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  39.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  39.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  39.08 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  38.37 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  37.93 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  44.59 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09420  YGGT family protein  44.78 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0374287  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  38.37 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  43.66 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  37.5 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  41.56 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  43.24 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  40.79 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  32.53 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  35.53 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  39.47 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  39.47 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  39.47 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  42.11 
 
 		 199 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  34.94 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  34.94 
 
 		 196 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  37.33 
 
 		 197 aa  53.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  43.24 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  38.96 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  43.24 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  33.77 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  40 
 
 		 237 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  37.33 
 
 		 196 aa  52  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  31.33 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  39.47 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  36 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0295  protein of unknown function YGGT  37.88 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  36.84 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  36.59 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  31.71 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1141  cell division membrane protein  42.59 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  34.48 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  32.53 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  40.91 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  32 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  36.25 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  34.67 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  32 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  31.08 
 
 		 194 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  31.33 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  31.33 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  31.33 
 
 		 196 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  38.24 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  30.38 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  29.89 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  33.75 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 		 192 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2059  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  35.85 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  35.85 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  30.65 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3520  protein of unknown function YGGT  43.75 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  32.53 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0891  YGGT family protein  35.8 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0499141  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  30.49 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  29.63 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  35.06 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  28 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  32.89 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  32.22 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  33.33 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0482  YGGT family protein  34.18 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0178  protein of unknown function YGGT  30.49 
 
 		 189 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00798567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  29.67 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  31.58 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  31.58 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0166  hypothetical protein  31.71 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000107926  hitchhiker  0.0000185577 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  34.94 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  35 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  30 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  30 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  35 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  36.14 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  30.12 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>