43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2176 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2176  restriction endonuclease  100 
 
 		 669 aa  1234    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2313  hypothetical protein  73.25 
 
 		 624 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2225  hypothetical protein  73.25 
 
 		 624 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00433627  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1635  hypothetical protein  72.73 
 
 		 643 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327312  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  77.46 
 
 		 1059 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  74.67 
 
 		 1053 aa  90.5  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2621  hypothetical protein  60 
 
 		 401 aa  70.5  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.335901 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2802  ribonuclease E  70.37 
 
 		 1088 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000361809  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.41 
 
 		 2449 aa  66.6  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0752  hypothetical protein  73.21 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0183997  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0520  ribonuclease E  61.11 
 
 		 1090 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000787566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2491  ribonuclease E  61.11 
 
 		 1090 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2791  ribonuclease E  61.11 
 
 		 1087 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000882056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  35.71 
 
 		 2313 aa  64.3  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1814  ribonuclease E  61.11 
 
 		 1087 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0112079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2918  ribonuclease E  61.11 
 
 		 1085 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000100731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2863  ribonuclease E  61.11 
 
 		 1088 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.829315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  29.11 
 
 		 3409 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0068  hypothetical protein  41.24 
 
 		 203 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1536  LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.413488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.98 
 
 		 14916 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1040  ribonuclease E protein  50 
 
 		 1014 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  28.12 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  31.75 
 
 		 625 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2922  ribonuclease, Rne/Rng family  76.19 
 
 		 1097 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000705961  normal  0.54344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  28.79 
 
 		 493 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  21.37 
 
 		 3242 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  17.59 
 
 		 521 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3489  diacylglycerol kinase catalytic region  33.71 
 
 		 541 aa  51.2  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0970  ribonuclease, Rne/Rng family  43.36 
 
 		 1008 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  70 
 
 		 1101 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  62.86 
 
 		 516 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1062  ribonuclease E  69.05 
 
 		 1096 aa  48.5  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  0.00000580995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0818  ribonuclease  76.47 
 
 		 1092 aa  47.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00158382  normal  0.513461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  42.72 
 
 		 1082 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 345 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  29.36 
 
 		 374 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  29.19 
 
 		 286 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  32.41 
 
 		 2397 aa  45.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2598  cation diffusion facilitator family transporter  52.94 
 
 		 405 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  43.55 
 
 		 1401 aa  45.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0905  ribonuclease, Rne/Rng family  48.65 
 
 		 1011 aa  45.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0755598  normal  0.0613595 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1768  hypothetical protein  35.14 
 
 		 584 aa  44.3  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.530857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>