More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2598 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2598  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 405 aa  775    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  59.13 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  39.64 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  37.43 
 
 		 333 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  37.43 
 
 		 333 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  38.36 
 
 		 314 aa  169  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  40.97 
 
 		 366 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  41.43 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  42.15 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  41.46 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  35.96 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  39.44 
 
 		 319 aa  162  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  40.14 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  40.51 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  39.53 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  35.06 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  37.54 
 
 		 313 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  35.74 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  37.67 
 
 		 322 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  37.67 
 
 		 322 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  29.78 
 
 		 300 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 314 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  38.59 
 
 		 329 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  33.13 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  39.3 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  32.38 
 
 		 312 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  32.38 
 
 		 312 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  28.88 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  28.92 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  38.56 
 
 		 308 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  34.62 
 
 		 312 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 307 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  33.01 
 
 		 312 aa  146  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 		 356 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  34.62 
 
 		 312 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0726  cation efflux protein  42.81 
 
 		 313 aa  146  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.951048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  34.62 
 
 		 312 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 306 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  28.57 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  34.62 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  34.62 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  38.98 
 
 		 306 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  28.57 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  29.25 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  35.54 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  28.91 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  30.99 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  32.78 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  28.88 
 
 		 299 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  34.36 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  37.25 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  37.25 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  37.25 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  37.25 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  31.36 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  33.55 
 
 		 297 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  37.25 
 
 		 313 aa  143  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  36.93 
 
 		 308 aa  143  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  36.72 
 
 		 309 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  36.93 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  36.93 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  28.23 
 
 		 324 aa  142  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  28.03 
 
 		 300 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  35.06 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  39.31 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  34.78 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  38.97 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  33.47 
 
 		 296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  36.59 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  41.06 
 
 		 307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  38.58 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  37.93 
 
 		 329 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 		 318 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  36.86 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  36.31 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  33.79 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  36.39 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  39.72 
 
 		 304 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  32.51 
 
 		 307 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  35.01 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  32.82 
 
 		 307 aa  136  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  34.24 
 
 		 305 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  34.24 
 
 		 305 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  37.33 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  36.71 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  32.54 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  30.8 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>