240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0805 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0805  transporter DMT superfamily protein  100 
 
 
298 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00148413  normal  0.0268128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  66.21 
 
 
301 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  66.21 
 
 
301 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0760  hypothetical protein  66.09 
 
 
301 aa  318  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  51.35 
 
 
303 aa  271  8e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.33 
 
 
309 aa  250  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  49.83 
 
 
294 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  46.96 
 
 
300 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  45.86 
 
 
313 aa  238  6e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  45.2 
 
 
295 aa  238  6e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.91 
 
 
305 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.09763e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  46.8 
 
 
335 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  4.43089e-05  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  45.52 
 
 
313 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  44.79 
 
 
313 aa  236  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.67 
 
 
307 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  43.39 
 
 
298 aa  236  5e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.02328e-06 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  44.44 
 
 
313 aa  235  5e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  45.17 
 
 
313 aa  236  5e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  44.83 
 
 
313 aa  236  5e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  44.83 
 
 
313 aa  236  5e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  44.83 
 
 
313 aa  236  5e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  44.01 
 
 
294 aa  236  5e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  44.83 
 
 
313 aa  236  5e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  44.33 
 
 
305 aa  235  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  45.52 
 
 
313 aa  235  8e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  43.75 
 
 
315 aa  235  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.67 
 
 
307 aa  234  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  43.64 
 
 
305 aa  234  1e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  43.66 
 
 
294 aa  234  1e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  41.75 
 
 
318 aa  233  2e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.05334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  43.97 
 
 
295 aa  233  2e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  50.67 
 
 
298 aa  233  2e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  43.97 
 
 
294 aa  231  8e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  44.17 
 
 
294 aa  231  8e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  47.31 
 
 
297 aa  231  8e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  48.08 
 
 
308 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  43.81 
 
 
304 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.1 
 
 
292 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  50 
 
 
298 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  42.32 
 
 
296 aa  228  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  40.55 
 
 
304 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  42.56 
 
 
294 aa  226  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.62 
 
 
304 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  43.58 
 
 
310 aa  226  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.91 
 
 
294 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  1.29202e-10 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  50.35 
 
 
301 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  42.91 
 
 
294 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  42.91 
 
 
294 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  42.91 
 
 
294 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  42.66 
 
 
295 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.67 
 
 
309 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  46.76 
 
 
300 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.92 
 
 
295 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  1.08784e-05  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  48.07 
 
 
297 aa  222  5e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  43.94 
 
 
302 aa  222  5e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  44.41 
 
 
296 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.33 
 
 
309 aa  222  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  44.41 
 
 
296 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  44.41 
 
 
296 aa  222  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3677  RarD protein, DMT superfamily transporter  52.61 
 
 
320 aa  222  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  47.22 
 
 
295 aa  221  1e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  2.35759e-14  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  48.42 
 
 
295 aa  221  1e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  1.81331e-13  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  45.21 
 
 
295 aa  221  1e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  47.57 
 
 
295 aa  220  2e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  6.82799e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  44.26 
 
 
298 aa  219  4e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.58 
 
 
302 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  42.61 
 
 
300 aa  219  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  43.69 
 
 
302 aa  219  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  42.32 
 
 
296 aa  218  8e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  42.32 
 
 
296 aa  218  8e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  42.32 
 
 
296 aa  218  8e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  42.32 
 
 
296 aa  218  8e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  42.32 
 
 
296 aa  218  8e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.32 
 
 
296 aa  218  8e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  42.91 
 
 
295 aa  218  9e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  42.91 
 
 
301 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  43.45 
 
 
293 aa  216  3e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  42.56 
 
 
295 aa  216  3e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.67 
 
 
306 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  44.03 
 
 
294 aa  214  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  44.18 
 
 
295 aa  213  3e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  44.18 
 
 
295 aa  213  3e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  44.18 
 
 
295 aa  213  3e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  44.44 
 
 
298 aa  213  4e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3520  rarD protein  44.44 
 
 
296 aa  212  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  42.33 
 
 
325 aa  211  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  38.83 
 
 
300 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  37.37 
 
 
306 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0680  rarD protein  42.86 
 
 
306 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  47.02 
 
 
295 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  4.46481e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  47.92 
 
 
304 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0719  transporter DMT superfamily protein  43.54 
 
 
313 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.69 
 
 
306 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  44.56 
 
 
310 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  49.12 
 
 
298 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0706  RarD protein  44.64 
 
 
310 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.33 
 
 
301 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0672  RarD protein  43.57 
 
 
290 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0940  transporter DMT superfamily protein  50.34 
 
 
301 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.31 
 
 
302 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  2.33047e-07  hitchhiker  2.96435e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>