More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4005 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 396 aa  781    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  44.84 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  49.1 
 
 		 400 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  42.68 
 
 		 402 aa  262  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  43.44 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  44.48 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  41.89 
 
 		 404 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  43.15 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  41.89 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  40.62 
 
 		 424 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  38.64 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  41.67 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  40.98 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  43.55 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  37.76 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  44.13 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  39.6 
 
 		 403 aa  215  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  39.84 
 
 		 377 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  38.56 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  38.54 
 
 		 397 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  38.56 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  39.47 
 
 		 400 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  39.95 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  39.78 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  39.78 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  39.4 
 
 		 403 aa  202  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  35.86 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  37.12 
 
 		 467 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  37.19 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  36.64 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  34.72 
 
 		 390 aa  193  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  39.14 
 
 		 371 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  39.25 
 
 		 400 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  33.06 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  34.15 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  38.53 
 
 		 398 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  41.54 
 
 		 411 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  38.24 
 
 		 408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  33.51 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  37.5 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  35.01 
 
 		 351 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  34.15 
 
 		 396 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  34.12 
 
 		 388 aa  162  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  32.71 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  32.58 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  32.7 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  35.03 
 
 		 388 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  33.51 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  34.49 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  35.83 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  33.78 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  33.53 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  34.42 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  34.82 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  33.13 
 
 		 405 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  31.83 
 
 		 496 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  32.41 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  35.23 
 
 		 392 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  30.63 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  32.09 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.23 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  31.87 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  27.71 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.08 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  33.01 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  28.79 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  29.2 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  27.39 
 
 		 376 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  27.07 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  28.66 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  31.27 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29.55 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  28.82 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  32.26 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  31.68 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  28.57 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  30.86 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  25.32 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  27.88 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  25.32 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  25.44 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  29.57 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  27.11 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  27.24 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  28.26 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  28.26 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  28.21 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  24.43 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  26.51 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  28.74 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  21.96 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  29.11 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  30.15 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  31.21 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  26.4 
 
 		 361 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  26.19 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  28.29 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  28.65 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  24.14 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>