More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2632 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 229 aa  447  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.04 
 
 		 228 aa  284  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  63.16 
 
 		 230 aa  281  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  63.16 
 
 		 231 aa  280  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  62.28 
 
 		 231 aa  279  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  64.6 
 
 		 227 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  61.84 
 
 		 230 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  61.84 
 
 		 230 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  61.84 
 
 		 230 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  57.92 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  62.72 
 
 		 229 aa  252  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.95 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  60.96 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.28 
 
 		 228 aa  245  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  56.77 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  61.16 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.11 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  54.19 
 
 		 228 aa  238  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.91 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.89 
 
 		 225 aa  234  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.22 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.09 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.18 
 
 		 229 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  56.33 
 
 		 237 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 224 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  53.57 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 		 225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  52.44 
 
 		 224 aa  224  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.02 
 
 		 238 aa  223  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0228  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.09 
 
 		 223 aa  218  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 406 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  48.9 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  48 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 224 aa  214  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 224 aa  214  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  49.55 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 239 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 239 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 239 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 235 aa  211  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  52.44 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 236 aa  208  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  47.56 
 
 		 252 aa  208  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  45.78 
 
 		 224 aa  207  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  45.78 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  46.67 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2914  two component transcriptional regulator  54.19 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.81 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.84 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  45.33 
 
 		 224 aa  204  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  45.33 
 
 		 224 aa  204  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 232 aa  204  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 248 aa  204  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  46.22 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  50.71 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4535  two component transcriptional regulator  50.71 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  50.71 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2886  response regulator receiver  51.77 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  46.46 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.79 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  51.18 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  50.47 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  50.47 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  48.67 
 
 		 241 aa  198  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 227 aa  197  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5196  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4346  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 384 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0299016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06261  two-component response regulator  45.18 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0419163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 227 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>