82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0132 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0132  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 298 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01490  predicted glycosyltransferase  80.27 
 
 		 303 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.731654  normal  0.0270435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0276  glycosyl transferase family 2  64.29 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0949477  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4321  glycosyl transferase family 2  65.16 
 
 		 307 aa  348  6e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4102  glycosyl transferase family 2  62.96 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.694392  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13816  L-rhamnosyltransferase  64.63 
 
 		 304 aa  343  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1185  glycosyl transferase family protein  62.77 
 
 		 304 aa  340  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5619  glycosyl transferase family protein  63.35 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5080  glycosyl transferase family protein  66.06 
 
 		 297 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.566674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4992  glycosyl transferase family protein  66.06 
 
 		 297 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5373  glycosyl transferase family protein  66.06 
 
 		 297 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  39.73 
 
 		 298 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2348  glycosyl transferase family 2  38.03 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000992199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  31.1 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  35.64 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  30.37 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  27.08 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  31.5 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  26.69 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 		 615 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  36.97 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0770  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.75 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 		 722 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  23.98 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  29.53 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  30.91 
 
 		 674 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.47 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.14 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  25.9 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 671 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 308 aa  52.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  24.46 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0780  putative glycosyl transferase  29.1 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.0469615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0877  putative glycosyl transferase  29.1 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277014 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  26.71 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 		 314 aa  49.3  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0843  putative glycosyl transferase  28.36 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  22.38 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  29.87 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  36.14 
 
 		 633 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0844  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.649715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  27.1 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  34.78 
 
 		 997 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  35.21 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  39.25 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4003  hypothetical protein  25 
 
 		 635 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.738232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20870  predicted glycosyltransferase  29.75 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  24.45 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0298  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 512 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.174752  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  22.68 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1207  glycosyl transferase domain-containing protein  27.66 
 
 		 1121 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0848  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  26.45 
 
 		 592 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0412528  decreased coverage  0.00000137113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0881  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  26.45 
 
 		 592 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22195  normal  0.346157 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0784  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  25.81 
 
 		 592 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.0467489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 335 aa  42.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  23.76 
 
 		 339 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2264  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.47 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 		 1299 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>