92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3930 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  100 
 
 		 274 aa  542  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  98.91 
 
 		 280 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  52.33 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  43.97 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.74 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  41.03 
 
 		 478 aa  82.8  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  41.03 
 
 		 478 aa  82.8  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.82 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.59 
 
 		 126 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.61 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  26.92 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  41.24 
 
 		 161 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  26.54 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.49 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  31.45 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.14 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  31.45 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.65 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3035  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4709  putative lipoprotein  33.59 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3075  putative lipoprotein  30 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000475601  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3216  putative lipoprotein  30 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696284  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  28.91 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  31.91 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.73 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  33.93 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  33.93 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.14 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0921  glycoprotein/polysaccharide metabolism  27.91 
 
 		 189 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.226366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.14 
 
 		 146 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  31.53 
 
 		 133 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  32.26 
 
 		 154 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  30.43 
 
 		 132 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0568  hypothetical protein  27.91 
 
 		 189 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0525  putative lipoprotein  27.91 
 
 		 189 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0515  putative lipoprotein  27.91 
 
 		 189 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0506  putative lipoprotein  27.91 
 
 		 189 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0509  putative lipoprotein  27.91 
 
 		 189 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3162  glycoprotein/polysaccharide metabolism  29.67 
 
 		 190 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00409  hypothetical protein  29.67 
 
 		 190 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0497  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 190 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0543  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 185 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50203  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00405  predicted outer membrane lipoprotein  29.67 
 
 		 190 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0489  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 190 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0530  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 190 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  31.3 
 
 		 149 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.93 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  29.13 
 
 		 143 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0743  hypothetical protein  30.97 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.46 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3054  lipoprotein  28.89 
 
 		 185 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0385716  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  33.64 
 
 		 141 aa  50.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1373  hypothetical protein  32.73 
 
 		 136 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0504546 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3156  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  30.36 
 
 		 132 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  30.36 
 
 		 132 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  30.36 
 
 		 132 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1112  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 163 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000897823  hitchhiker  0.00000162029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1063  lipoprotein  27.97 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  30.16 
 
 		 144 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1471  hypothetical protein  30.28 
 
 		 133 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0482642  hitchhiker  0.000540477 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2838  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  45.71 
 
 		 127 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  37.33 
 
 		 138 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.2 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2085  heat shock protein  25.85 
 
 		 147 aa  46.2  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  28.68 
 
 		 142 aa  46.2  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.21 
 
 		 138 aa  46.2  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2785  hypothetical protein  28.7 
 
 		 133 aa  46.2  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3248  lipoprotein  27.97 
 
 		 194 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.84 
 
 		 138 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.84 
 
 		 138 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0558  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.84 
 
 		 138 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36 
 
 		 138 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36 
 
 		 138 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  29 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36 
 
 		 138 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  28.21 
 
 		 147 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0212  hypothetical protein  28.23 
 
 		 176 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  27.66 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04470  hypothetical protein  30.56 
 
 		 137 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.1707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  27.52 
 
 		 143 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  26.39 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25 
 
 		 143 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.61 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30 
 
 		 397 aa  42.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.75 
 
 		 153 aa  42.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.71 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.21 
 
 		 137 aa  42.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2599  hypothetical protein  27.78 
 
 		 144 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664036  hitchhiker  0.00000856257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3638  hypothetical protein  26.79 
 
 		 300 aa  42  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2630  hypothetical protein  28.4 
 
 		 297 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.427988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>