57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3248 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3248  lipoprotein  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1063  lipoprotein  92.78 
 
 		 193 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1006  lipoprotein  64.05 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.882896  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3054  lipoprotein  61.84 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0385716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0515  putative lipoprotein  54.27 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0568  hypothetical protein  54.27 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0525  putative lipoprotein  54.27 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0506  putative lipoprotein  54.27 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0509  putative lipoprotein  54.27 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1112  putative lipoprotein  56.52 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000897823  hitchhiker  0.00000162029 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0921  glycoprotein/polysaccharide metabolism  48.69 
 
 		 189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.226366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00409  hypothetical protein  51.83 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00405  predicted outer membrane lipoprotein  51.83 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0489  putative lipoprotein  51.83 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0530  putative lipoprotein  51.83 
 
 		 190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0497  putative lipoprotein  51.83 
 
 		 190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3162  glycoprotein/polysaccharide metabolism  51.83 
 
 		 190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0543  putative lipoprotein  56.94 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50203  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3156  conserved hypothetical protein  51.22 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3035  hypothetical protein  50.32 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3216  putative lipoprotein  50.32 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3075  putative lipoprotein  50.32 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000475601  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  48.45 
 
 		 144 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  42.71 
 
 		 144 aa  87.8  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  41.51 
 
 		 162 aa  85.1  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4709  putative lipoprotein  36.43 
 
 		 144 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  38.95 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  40.23 
 
 		 132 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  40.96 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  40.96 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0212  hypothetical protein  28.45 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  36 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.1 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  35.63 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  33.72 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  34.48 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  34.48 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  33.94 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.48 
 
 		 284 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2630  hypothetical protein  31.29 
 
 		 297 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  34.15 
 
 		 478 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.15 
 
 		 478 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  35.11 
 
 		 246 aa  51.6  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  41.79 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1519  hypothetical protein  35.92 
 
 		 116 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.81 
 
 		 280 aa  48.1  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1194  hypothetical protein  26.88 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2785  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1471  hypothetical protein  30.49 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0482642  hitchhiker  0.000540477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.97 
 
 		 274 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1327  hypothetical protein  39.36 
 
 		 116 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0545015 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  34.34 
 
 		 142 aa  45.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  26.92 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  28.37 
 
 		 297 aa  42  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  28.37 
 
 		 267 aa  42  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1467  hypothetical protein  25.44 
 
 		 129 aa  41.2  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000434659  decreased coverage  0.0000172083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>