37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0558 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0558  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  34.26 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  32.17 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  28.91 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  27.68 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2630  hypothetical protein  33.94 
 
 		 297 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4709  putative lipoprotein  29.32 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  28.95 
 
 		 478 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.95 
 
 		 478 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0743  hypothetical protein  33.94 
 
 		 288 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  31.93 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  31.93 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0212  hypothetical protein  22.9 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  29.46 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.72 
 
 		 282 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.08 
 
 		 305 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  30.11 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  25.93 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  37.35 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.48 
 
 		 274 aa  42.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.48 
 
 		 280 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  26.77 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  27.07 
 
 		 133 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  31.43 
 
 		 267 aa  41.6  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1194  hypothetical protein  23.89 
 
 		 228 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3156  conserved hypothetical protein  31.4 
 
 		 190 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0509  putative lipoprotein  28.37 
 
 		 189 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0506  putative lipoprotein  28.37 
 
 		 189 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0525  putative lipoprotein  28.37 
 
 		 189 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0568  hypothetical protein  28.37 
 
 		 189 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0515  putative lipoprotein  28.37 
 
 		 189 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.43 
 
 		 267 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1063  lipoprotein  29.41 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  31.43 
 
 		 297 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  30.77 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  28.57 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>