44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0743 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0743  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  36.28 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2630  hypothetical protein  40.37 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1889  hypothetical protein  37.72 
 
 		 159 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  30.97 
 
 		 144 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  38.78 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  33.64 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  28.93 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  29.46 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.46 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0212  hypothetical protein  29.51 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  31.71 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  31.71 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  39.77 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  38.46 
 
 		 149 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  36.46 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.04 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3035  hypothetical protein  35.24 
 
 		 210 aa  53.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3216  putative lipoprotein  35.24 
 
 		 173 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3075  putative lipoprotein  35.24 
 
 		 173 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000475601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  34.09 
 
 		 132 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0738  hypothetical protein  31.73 
 
 		 141 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.98341  normal  0.262809 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.97 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  30.89 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  35.71 
 
 		 132 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.97 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0558  hypothetical protein  33.94 
 
 		 138 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.28 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  29.07 
 
 		 144 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1194  hypothetical protein  36.59 
 
 		 228 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  27.91 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  31.82 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  31.82 
 
 		 132 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  31.46 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1523  hypothetical protein  27.91 
 
 		 139 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0159792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1492  hypothetical protein  27.91 
 
 		 139 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000310821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2859  hypothetical protein  27.91 
 
 		 139 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00929385  hitchhiker  0.00000000043608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2773  hypothetical protein  27.91 
 
 		 144 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  hitchhiker  0.00136931 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2666  hypothetical protein  27.91 
 
 		 144 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000306187  normal  0.191163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1487  hypothetical protein  27.91 
 
 		 139 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0816292  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  31.11 
 
 		 132 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  31.11 
 
 		 132 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.3 
 
 		 450 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2599  hypothetical protein  27.91 
 
 		 144 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664036  hitchhiker  0.00000856257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>