89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4099 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  100 
 
 
132 aa  270  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  93.18 
 
 
132 aa  253  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  91.67 
 
 
132 aa  246  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  91.67 
 
 
132 aa  246  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  71.97 
 
 
132 aa  186  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  64.39 
 
 
132 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  63.64 
 
 
132 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  43.06 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  46.83 
 
 
143 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1471  hypothetical protein  43.65 
 
 
133 aa  100  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0482642  hitchhiker  0.000540477 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  44.17 
 
 
144 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  47.15 
 
 
133 aa  98.2  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  46.15 
 
 
141 aa  97.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  42.31 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  41.13 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  47.92 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1675  hypothetical protein  40.62 
 
 
125 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2785  hypothetical protein  40.8 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2666  hypothetical protein  39.06 
 
 
144 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000306187  normal  0.191163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2599  hypothetical protein  39.06 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664036  hitchhiker  0.00000856257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2773  hypothetical protein  39.06 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  hitchhiker  0.00136931 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2859  hypothetical protein  36.64 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00929385  hitchhiker  0.00000000043608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1487  hypothetical protein  36.64 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0816292  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1523  hypothetical protein  36.64 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0159792  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1492  hypothetical protein  36.64 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000310821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1519  hypothetical protein  44.95 
 
 
116 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.31 
 
 
267 aa  87  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  43.27 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1327  hypothetical protein  44.14 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0545015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1373  hypothetical protein  39.06 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  38.68 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  35.88 
 
 
246 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  37.04 
 
 
297 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  37.04 
 
 
267 aa  73.9  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1194  hypothetical protein  44.83 
 
 
228 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0506  putative lipoprotein  34.85 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0509  putative lipoprotein  34.85 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0515  putative lipoprotein  34.85 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0568  hypothetical protein  34.31 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0525  putative lipoprotein  34.85 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465904  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3156  conserved hypothetical protein  43.53 
 
 
190 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3216  putative lipoprotein  37 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3035  hypothetical protein  37 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1112  putative lipoprotein  40.62 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000897823  hitchhiker  0.00000162029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3075  putative lipoprotein  37 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000475601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4709  putative lipoprotein  34.96 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100593  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3162  glycoprotein/polysaccharide metabolism  43.53 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0497  putative lipoprotein  43.53 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0530  putative lipoprotein  43.53 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0489  putative lipoprotein  43.53 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00405  predicted outer membrane lipoprotein  43.53 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00409  hypothetical protein  43.53 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0543  putative lipoprotein  39.6 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50203  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.96 
 
 
305 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.55 
 
 
282 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0921  glycoprotein/polysaccharide metabolism  34.71 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.226366  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2630  hypothetical protein  45.78 
 
 
297 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.19 
 
 
478 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  36.19 
 
 
478 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3248  lipoprotein  36 
 
 
194 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1063  lipoprotein  35.63 
 
 
193 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1467  hypothetical protein  25 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000434659  decreased coverage  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  35.65 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3054  lipoprotein  30.93 
 
 
185 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0385716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3209  hypothetical protein  25.76 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000120435  unclonable  0.0000000114703 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2555  hypothetical protein  23.44 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2790  hypothetical protein  29.91 
 
 
132 aa  52  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0273206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1913  hypothetical protein  24.3 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.57 
 
 
284 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0212  hypothetical protein  29.55 
 
 
176 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.63 
 
 
280 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1369  hypothetical protein  25 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.741634  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0558  hypothetical protein  29.46 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1671  hypothetical protein  25 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000194021  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0108  hypothetical protein  32.22 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1620  hypothetical protein  26.42 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1695  hypothetical protein  24.75 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362042  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2835  hypothetical protein  24.74 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1541  hypothetical protein  24.74 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2960  hypothetical protein  24.74 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.946654  normal  0.485074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2817  hypothetical protein  24.74 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.61 
 
 
274 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2721  hypothetical protein  24.39 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0743  hypothetical protein  31.82 
 
 
288 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1729  hypothetical protein  23.81 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0266  hypothetical protein  28.44 
 
 
136 aa  43.5  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1689  hypothetical protein  25.47 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.729509  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.58 
 
 
234 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1889  hypothetical protein  34.62 
 
 
159 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>