More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2355 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  67.17 
 
 		 1140 aa  1318    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  53.22 
 
 		 1165 aa  992    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  55.75 
 
 		 1095 aa  1093    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  99.55 
 
 		 1101 aa  2178    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  46.74 
 
 		 1086 aa  704    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  56.63 
 
 		 1087 aa  1129    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  67.86 
 
 		 1168 aa  1418    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  54.62 
 
 		 1103 aa  1035    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1101 aa  2189    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  34.53 
 
 		 1173 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  33.71 
 
 		 1197 aa  438  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  34.31 
 
 		 1187 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  30.34 
 
 		 1185 aa  389  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  33.09 
 
 		 1173 aa  386  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  34.64 
 
 		 1089 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  32.14 
 
 		 1147 aa  339  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  34.39 
 
 		 1173 aa  323  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.64 
 
 		 1156 aa  221  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.44 
 
 		 1177 aa  214  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  27.23 
 
 		 1121 aa  206  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  28.48 
 
 		 1124 aa  204  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  27.55 
 
 		 1180 aa  204  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  27.32 
 
 		 1164 aa  202  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  26.39 
 
 		 1161 aa  201  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  27.33 
 
 		 1180 aa  198  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  29.14 
 
 		 1147 aa  198  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  28.21 
 
 		 1151 aa  197  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  26.59 
 
 		 1162 aa  195  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  28.57 
 
 		 1180 aa  193  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  28.85 
 
 		 1120 aa  193  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  26.11 
 
 		 1161 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  28.71 
 
 		 1185 aa  189  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  27.95 
 
 		 1119 aa  188  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  25.96 
 
 		 1156 aa  186  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  24.52 
 
 		 1155 aa  186  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  22.63 
 
 		 1089 aa  183  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  27.19 
 
 		 1189 aa  183  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  29 
 
 		 1147 aa  180  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  28.85 
 
 		 1147 aa  180  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  26.17 
 
 		 1125 aa  180  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.71 
 
 		 1183 aa  179  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  22.76 
 
 		 854 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  26.18 
 
 		 1164 aa  174  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  26.02 
 
 		 1157 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 1202 aa  168  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.03 
 
 		 860 aa  168  6.9999999999999995e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  27.08 
 
 		 1106 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  25.62 
 
 		 1182 aa  166  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  29.49 
 
 		 1165 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  27.17 
 
 		 1161 aa  165  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  28.06 
 
 		 1166 aa  164  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  27.59 
 
 		 1159 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  26.3 
 
 		 1183 aa  158  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  28.49 
 
 		 1187 aa  158  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.74 
 
 		 1241 aa  155  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  24.72 
 
 		 1241 aa  154  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.53 
 
 		 1241 aa  153  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.74 
 
 		 1241 aa  154  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.32 
 
 		 1241 aa  153  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.84 
 
 		 1241 aa  154  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.64 
 
 		 1241 aa  154  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.77 
 
 		 1240 aa  153  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  24.74 
 
 		 1241 aa  152  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  24.74 
 
 		 1241 aa  152  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  27.68 
 
 		 1167 aa  151  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  28.05 
 
 		 1157 aa  151  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.91 
 
 		 1186 aa  145  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  23.24 
 
 		 1204 aa  142  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  23.92 
 
 		 1161 aa  139  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1061 aa  137  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1057 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  28.26 
 
 		 1106 aa  137  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  29.34 
 
 		 1157 aa  131  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  27.89 
 
 		 1142 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  23.7 
 
 		 1217 aa  129  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1751  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.56 
 
 		 1129 aa  128  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.910924 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  22.05 
 
 		 1248 aa  126  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  23.7 
 
 		 1282 aa  125  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  23.96 
 
 		 1217 aa  122  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  23.96 
 
 		 1217 aa  122  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  25.72 
 
 		 1242 aa  121  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  24.23 
 
 		 1392 aa  121  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  25.74 
 
 		 1244 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0468  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1134 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  24.3 
 
 		 939 aa  117  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  27.93 
 
 		 1117 aa  115  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 1149 aa  115  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  24.28 
 
 		 1233 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  27.71 
 
 		 1132 aa  115  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.41 
 
 		 1203 aa  115  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  24.49 
 
 		 915 aa  114  8.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  23.58 
 
 		 1218 aa  114  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  30.65 
 
 		 1196 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  27.01 
 
 		 1242 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  25.83 
 
 		 921 aa  113  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  22.81 
 
 		 1121 aa  111  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  21.16 
 
 		 1036 aa  111  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.96 
 
 		 1230 aa  110  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  27.13 
 
 		 1047 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  27.34 
 
 		 1131 aa  109  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>