More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1969 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 487 aa  933    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 450 aa  133  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 		 459 aa  131  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  29.46 
 
 		 461 aa  130  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  30.61 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  26.99 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  32.75 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  30.03 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 		 462 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 		 462 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 		 462 aa  113  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  30.81 
 
 		 463 aa  113  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  31.21 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  26.36 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  26.46 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  31.63 
 
 		 456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  29.18 
 
 		 521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  31.58 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 516 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  30.55 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 463 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 497 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  28.46 
 
 		 449 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  29.76 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  27.02 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  32.87 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  29.7 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  28.1 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  30.98 
 
 		 453 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 450 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 526 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  29.02 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  27.04 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  27.23 
 
 		 465 aa  107  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  31.23 
 
 		 457 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  31.23 
 
 		 457 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  28.08 
 
 		 464 aa  107  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  31.23 
 
 		 457 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 450 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  32.25 
 
 		 434 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 483 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 		 457 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  30.4 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  30.4 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  30.4 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  30.4 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  30.4 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  30.09 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  30.09 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  30.09 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 		 456 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  30.09 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  30.09 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  30.09 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 510 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  30.09 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 447 aa  104  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 504 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  29.32 
 
 		 450 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 450 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 495 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 484 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  28.5 
 
 		 461 aa  103  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  28.24 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  28.24 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  28.24 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  27.88 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  27.88 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  27.69 
 
 		 456 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 464 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 476 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1639  amino acid permease-associated region  28.82 
 
 		 446 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00236467  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  25.71 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  27.1 
 
 		 456 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 510 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  30.67 
 
 		 453 aa  98.2  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>