More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1124 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  60.63 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  56.67 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  54.33 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  56.25 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  55.91 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  58.78 
 
 		 134 aa  140  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  54.69 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  54.69 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  54.4 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  50.78 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  56.56 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  53.85 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 126 aa  133  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 134 aa  133  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  54.84 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  52.8 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  54.55 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  58.65 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  127  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 130 aa  127  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  47.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  59.8 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  48.03 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  51.67 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  54.17 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  48.12 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0051  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  47.93 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  54.81 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  51.38 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  51.26 
 
 		 135 aa  123  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3846  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>