193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2151 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 110 aa  216  8.999999999999998e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  36 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  34.02 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  32.41 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  32.46 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  36.05 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  32.73 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  34.58 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  39.77 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  30.09 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  30.09 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  30.7 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  30.56 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  33.33 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  30 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  38.68 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  30.7 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  30.7 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  30.7 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  30.7 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  30.7 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  34.29 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  30.7 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  33.96 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  34.44 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  34.34 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  33.68 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  32.69 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  33.66 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  38.78 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  36.73 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  29.17 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  36.73 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  38.78 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  34.31 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  37.76 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  31.19 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  38.54 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  34.62 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  41.98 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  31.07 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  25.45 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  35.71 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  31.07 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  30.53 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  30.53 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  40.45 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  33.63 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  47.06 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  31.43 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  35.71 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  29.7 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2523  ribonuclease P protein component  44.87 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0265349  hitchhiker  0.0000065266 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  34.07 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  43.48 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  27.62 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  27.62 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  31.03 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  34.95 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  35.16 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  35.42 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  32.99 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  36.05 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  32.41 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  36.78 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  29.91 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  33.68 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  30.48 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  34.31 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  53.06 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  29.52 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  31.91 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  30.69 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  30.48 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  46.48 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  35.63 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  35.63 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  30.19 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  45.71 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  40.7 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  55.1 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  30.84 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  39.29 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  38.71 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  40.32 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  32.99 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  27.78 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  30.53 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  34.07 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  28.57 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  28.57 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  28.57 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  28.57 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  28.57 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>