222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1494 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  100 
 
 
257 aa  498  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  60.54 
 
 
289 aa  261  8e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  42.54 
 
 
320 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  41.6 
 
 
304 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  44.64 
 
 
296 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  39.69 
 
 
298 aa  158  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  44.04 
 
 
308 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  39.1 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  39.1 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  47.35 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  45.3 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  41.76 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  45.15 
 
 
297 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  45.15 
 
 
297 aa  151  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  39.23 
 
 
294 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  44.69 
 
 
295 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  48.21 
 
 
292 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  38.31 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
298 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  39.18 
 
 
305 aa  142  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  39.39 
 
 
305 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  38.89 
 
 
289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  40.33 
 
 
311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  36.8 
 
 
296 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  43.2 
 
 
293 aa  132  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  38.3 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  38.28 
 
 
289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  38.79 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  38.28 
 
 
312 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  44.26 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  46.46 
 
 
299 aa  125  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  45.4 
 
 
270 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  45.4 
 
 
270 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  40.09 
 
 
277 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  38.19 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  42.6 
 
 
279 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.255454 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  31.05 
 
 
376 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  36.05 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  39.77 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  30.08 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  36 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  30.84 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  38.36 
 
 
277 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  29.64 
 
 
354 aa  106  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  37.85 
 
 
274 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  32.79 
 
 
295 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  32.79 
 
 
295 aa  99.8  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  34.62 
 
 
291 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  36.18 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  37.21 
 
 
348 aa  88.2  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  34.58 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  25.95 
 
 
309 aa  87  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  29.3 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  32.59 
 
 
290 aa  85.9  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  29.59 
 
 
292 aa  85.5  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  29.59 
 
 
292 aa  85.5  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  25.53 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  39.47 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  27.73 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  29.22 
 
 
291 aa  82  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  32.56 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  26.49 
 
 
291 aa  79  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  27.47 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  28.81 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  30.19 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  28.39 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  29.86 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  28.25 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  27.09 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  28.25 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  24.34 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  26.47 
 
 
297 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  28.49 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  26.94 
 
 
558 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.06 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  26.18 
 
 
300 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  27.07 
 
 
301 aa  62.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  28.27 
 
 
319 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  27.13 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  28.39 
 
 
338 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
271 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  25.34 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  30.94 
 
 
267 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 
320 aa  58.9  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  25.41 
 
 
265 aa  58.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  31.11 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  33.85 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  30.28 
 
 
267 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.71 
 
 
321 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
321 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
321 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  27.65 
 
 
300 aa  55.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
267 aa  55.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 
321 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  33.88 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  25.57 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  25.41 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>