258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1199 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
88 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  60 
 
 
76 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  56.58 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  55 
 
 
86 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.55 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.38 
 
 
94 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
94 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.14 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.86 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.68 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.11 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.53 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.12 
 
 
80 aa  67  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.71 
 
 
93 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  51.56 
 
 
80 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.3 
 
 
83 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.31 
 
 
83 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.52 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.53 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.53 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.32 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.77 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.67 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.67 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.54 
 
 
85 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  54.24 
 
 
83 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.61 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  51.56 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  51.56 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.97 
 
 
84 aa  60.8  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2131  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.73 
 
 
85 aa  60.5  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.62561  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.06 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.59 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.28 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.28 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.93 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.19 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.19 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.37 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.28 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.31 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  43.06 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2781  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.28 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.210066  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.91 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0923  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00562605  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.75 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.32 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.19 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.19 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.16 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.55 
 
 
76 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.31 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.85 
 
 
88 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.9 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3371  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.03 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.54 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.88 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
82 aa  53.9  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.21 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  46.88 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.31 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.31 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1424  Exonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
77 aa  53.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.506182  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.31 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.15 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.9 
 
 
80 aa  53.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.43 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.91 
 
 
78 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3774  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
97 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00863673  normal  0.0479075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0234  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.733912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
83 aa  52  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3248  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
97 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344342  normal  0.0166439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2989  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.71 
 
 
82 aa  52  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1706  exonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 
77 aa  52  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>