168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1671 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  100 
 
 
207 aa  397  1e-110  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  50 
 
 
204 aa  158  7e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  44.67 
 
 
199 aa  150  9e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  50.53 
 
 
197 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  50.32 
 
 
206 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  43.75 
 
 
197 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  50 
 
 
205 aa  134  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  48.15 
 
 
192 aa  132  2e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  44.79 
 
 
191 aa  133  2e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  43.27 
 
 
203 aa  128  5e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  42.86 
 
 
200 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  43.27 
 
 
197 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  42.86 
 
 
205 aa  121  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  47.17 
 
 
195 aa  118  8e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  50.29 
 
 
203 aa  117  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  44.1 
 
 
189 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  45.74 
 
 
196 aa  111  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  35.06 
 
 
190 aa  108  4e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  4.21582e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  38.76 
 
 
184 aa  107  9e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  41.55 
 
 
198 aa  105  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  2.83482e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  40.51 
 
 
205 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  38.22 
 
 
182 aa  101  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  9.40294e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  41.36 
 
 
179 aa  99  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  51.79 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  37.43 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  37.43 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  8.44147e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  38.75 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  47.27 
 
 
187 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  36.46 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  38.46 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  40.52 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  36.47 
 
 
175 aa  87.8  9e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  38.55 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  3.30178e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  40.34 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  30.49 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.2911e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  32.89 
 
 
184 aa  86.3  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.66759e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  33.33 
 
 
231 aa  85.5  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  35.06 
 
 
171 aa  85.1  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  32.32 
 
 
184 aa  83.2  2e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  34.69 
 
 
191 aa  83.2  2e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  40 
 
 
199 aa  84  2e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  34.69 
 
 
191 aa  83.2  2e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  37.25 
 
 
208 aa  82.8  3e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  40.58 
 
 
169 aa  82.4  4e-15  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  38.1 
 
 
190 aa  81.6  6e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  40.13 
 
 
189 aa  80.9  1e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  34.71 
 
 
167 aa  80.1  2e-14  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.11141e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  40.54 
 
 
200 aa  80.1  2e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  42.36 
 
 
185 aa  80.5  2e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  36.76 
 
 
182 aa  80.5  2e-14  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  43.79 
 
 
212 aa  79.7  3e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  34.18 
 
 
191 aa  79  4e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  34.87 
 
 
187 aa  78.6  6e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  31.76 
 
 
203 aa  77.8  1e-13  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.63296e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2356  BioY protein  41.04 
 
 
200 aa  77.8  1e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  34.71 
 
 
181 aa  75.9  4e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  35.29 
 
 
199 aa  75.5  5e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  38.01 
 
 
224 aa  73.9  1e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  37.82 
 
 
165 aa  73.6  2e-12  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  35.88 
 
 
199 aa  72.8  3e-12  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  35.88 
 
 
199 aa  72.8  3e-12  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  40.94 
 
 
182 aa  73.2  3e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  33.96 
 
 
212 aa  72.8  4e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  41.91 
 
 
145 aa  72  5e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  41.48 
 
 
169 aa  72  6e-12  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  34.78 
 
 
210 aa  70.9  1e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  32.41 
 
 
182 aa  71.2  1e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  3.03529e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  35.92 
 
 
169 aa  69.7  3e-11  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  34.55 
 
 
174 aa  69.3  3e-11  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  7.75885e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  35.92 
 
 
169 aa  69.7  3e-11  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  43.45 
 
 
197 aa  69.7  3e-11  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  35.66 
 
 
187 aa  69.7  3e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  32.63 
 
 
201 aa  69.3  4e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  34.66 
 
 
192 aa  69.3  4e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  35.81 
 
 
184 aa  68.9  4e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  46.25 
 
 
208 aa  68.6  6e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  3.26686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  35.82 
 
 
169 aa  68.6  6e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  34.72 
 
 
187 aa  68.6  7e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  31.52 
 
 
189 aa  68.6  7e-11  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  43.06 
 
 
185 aa  68.2  8e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  36.11 
 
 
216 aa  67.4  1e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  27.7 
 
 
191 aa  67  2e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.66456e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  39.13 
 
 
193 aa  67.4  2e-10  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  38.06 
 
 
190 aa  66.6  3e-10  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  38.41 
 
 
180 aa  66.6  3e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  44.6 
 
 
204 aa  66.2  4e-10  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  37.5 
 
 
202 aa  65.9  4e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  27.03 
 
 
191 aa  65.9  4e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  7.0307e-10  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  36 
 
 
197 aa  65.5  5e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  35 
 
 
182 aa  65.5  5e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  31.51 
 
 
179 aa  65.9  5e-10  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.4315e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  35.92 
 
 
192 aa  65.5  6e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  33.11 
 
 
207 aa  65.1  7e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  40 
 
 
225 aa  63.9  1e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  26.35 
 
 
191 aa  64.3  1e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  33.74 
 
 
196 aa  64.3  1e-09  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  33.56 
 
 
197 aa  63.2  2e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  30.61 
 
 
192 aa  63.5  2e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.69732e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  29.79 
 
 
202 aa  63.2  2e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.12957e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  30.89 
 
 
200 aa  63.9  2e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>