46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1734 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1734  phage integrase family protein  100 
 
 		 356 aa  734    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1089  phage-related integrase  59.46 
 
 		 85 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00193987  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1569  phage-related integrase  59.46 
 
 		 85 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0222681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1545  phage integrase family protein  59.46 
 
 		 85 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  25.63 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  26.92 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  26.25 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  24.14 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  25.94 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  23.47 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  22.74 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  25 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  27.54 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0631  phage-related integrase  24.17 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1139  phage-related integrase  24.17 
 
 		 397 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  23.99 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01326  site-specific recombinase, phage integrase family  27.22 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0890687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 402 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  25.63 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  25.08 
 
 		 344 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  23.61 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  24.23 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  25.74 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  23.14 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.57 
 
 		 388 aa  46.2  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  25.26 
 
 		 413 aa  46.2  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4147  integrase family protein  22.45 
 
 		 447 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  24.02 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  26.03 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  24.25 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  22.88 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  22.88 
 
 		 414 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  24.12 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  22.88 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  29.57 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  27.56 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.7 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  24.89 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3889  phage integrase, putative  25.33 
 
 		 432 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000353876 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  28.22 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04071  site-specific recombinase, phage integrase family  21.75 
 
 		 424 aa  43.5  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0594853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  28.63 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  26.67 
 
 		 404 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  29.37 
 
 		 276 aa  42.7  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>