More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_12191 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_12191  two-component response regulator  100 
 
 
245 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12201  two-component response regulator  98.78 
 
 
245 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1124  two component transcriptional regulator  98.37 
 
 
245 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.747385  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12041  two-component response regulator  94.29 
 
 
245 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14691  two-component response regulator  85.6 
 
 
254 aa  417  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.132919  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0637  two component transcriptional regulator  84.77 
 
 
254 aa  414  1e-115  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10741  two-component response regulator  82.72 
 
 
253 aa  406  1e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.6748  normal  0.476157 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09491  two-component response regulator  82.38 
 
 
234 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.228862 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1420  two component transcriptional regulator  82.91 
 
 
234 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1663  two component transcriptional regulator  84.58 
 
 
255 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650844  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4398  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.4 
 
 
263 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.184239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2466  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 
235 aa  132  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.28267  hitchhiker  1.26243e-11 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0851  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.36 
 
 
261 aa  128  7e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.0165752 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2736  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 
257 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00867541  hitchhiker  4.94299e-08 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3375  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 
257 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  38.12 
 
 
226 aa  119  4e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1263  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 
256 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.5 
 
 
231 aa  115  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2789  winged helix family two component transcriptional regulator  32.59 
 
 
256 aa  115  8e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.08 
 
 
227 aa  114  1e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 
225 aa  113  2e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  31.39 
 
 
222 aa  113  4e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  35.4 
 
 
230 aa  112  4e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 
227 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 
227 aa  111  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1659  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 
245 aa  111  1e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  31.96 
 
 
224 aa  110  2e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.9 
 
 
232 aa  110  2e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  31.96 
 
 
224 aa  110  2e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.72 
 
 
227 aa  110  2e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 
234 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1866  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  32.14 
 
 
229 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  30.59 
 
 
219 aa  108  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  33.19 
 
 
229 aa  109  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 
230 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 
231 aa  108  7e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0195  two component transcriptional regulator  35.32 
 
 
222 aa  108  8e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 
223 aa  108  8e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  31.51 
 
 
224 aa  108  9e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  31.51 
 
 
224 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2151  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  32.59 
 
 
229 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.48 
 
 
231 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  31.05 
 
 
224 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  32.6 
 
 
229 aa  106  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0675  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 
252 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  0.0931169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  31.05 
 
 
224 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1397  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 
261 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0231814  hitchhiker  0.000111966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2348  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 
224 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000162881  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3534  response regulator receiver protein  33.78 
 
 
225 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868885  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 
229 aa  105  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2563  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 
230 aa  105  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.42 
 
 
225 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 
231 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0753  putative response regulator  33.91 
 
 
240 aa  105  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.82 
 
 
230 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3452  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 
229 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00686704  hitchhiker  0.000158375 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
231 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2855  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  33.04 
 
 
223 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  34.89 
 
 
251 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1608  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  33.04 
 
 
223 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.09 
 
 
231 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5456  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.47 
 
 
251 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.228477  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  31.05 
 
 
223 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1715  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  33.04 
 
 
223 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 
238 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  32.3 
 
 
229 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.27834e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.65 
 
 
236 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
229 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.01285e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  33.63 
 
 
240 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  32.05 
 
 
239 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 
229 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  4.60678e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 
219 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
231 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 
229 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 
229 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 
226 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2781  two component transcriptional regulator  31.28 
 
 
241 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2015  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.31 
 
 
228 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 
219 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 
228 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32.3 
 
 
229 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.20801e-07  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 
229 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  6.57343e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 
229 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.91119e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.11 
 
 
239 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 
225 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.91 
 
 
217 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 
229 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.43261e-07  hitchhiker  6.15281e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 
229 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.28627e-07  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  36.09 
 
 
243 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 
229 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.07229e-06  decreased coverage  2.63688e-07 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  36.09 
 
 
243 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  36.09 
 
 
243 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0109  response regulator receiver  33.93 
 
 
225 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  6.62688e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.31 
 
 
218 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 
225 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 
241 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  5.93879e-06  unclonable  3.30773e-06 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  30.8 
 
 
227 aa  102  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  36.71 
 
 
250 aa  102  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  31.56 
 
 
238 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.31 
 
 
231 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>