113 genes were found for organism Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Apre_1740  CDS  NC_013164  44  214  171  hypothetical protein  YP_003142323  hitchhiker  0.000625194  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1741  CDS  NC_013164  204  2390  2187  Radical SAM domain protein  YP_003142324  normal  0.0185422  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1742  CDS  NC_013164  2392  2517  126  hypothetical protein  YP_003142325  hitchhiker  0.00290143  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1743  CDS  NC_013164  2659  4287  1629  ABC transporter related  YP_003142326  hitchhiker  0.00261821  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1744  CDS  NC_013164  4632  7214  2583  serine/threonine protein kinase  YP_003142327  hitchhiker  0.00380667  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1745  CDS  NC_013164  7250  8866  1617  ABC transporter related  YP_003142328  decreased coverage  0.000253121  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1746  CDS  NC_013164  9424  9546  123  hypothetical protein  YP_003142329  hitchhiker  0.000539345  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1747  CDS  NC_013164  9611  9733  123  hypothetical protein  YP_003142330  hitchhiker  0.00151996  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1748  CDS  NC_013164  9798  9920  123  hypothetical protein  YP_003142331  hitchhiker  0.0015688  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1749    NC_013164  10527  10833  307      hitchhiker  0.000562122  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1750  CDS  NC_013164  11163  11732  570  hypothetical protein  YP_003142332  hitchhiker  0.00302655  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1751  CDS  NC_013164  11726  11989  264  hypothetical protein  YP_003142333  hitchhiker  0.00822719  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1752  CDS  NC_013164  12002  12430  429  hypothetical protein  YP_003142334  normal  0.0235038  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1753  CDS  NC_013164  12553  12705  153  hypothetical protein  YP_003142335  hitchhiker  0.00692037  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1754  CDS  NC_013164  12796  14139  1344  Radical SAM domain protein  YP_003142336  normal  0.0305986  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1755  CDS  NC_013164  14149  14823  675  ABC transporter related  YP_003142337  normal  0.0195851  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1756  CDS  NC_013164  14825  16915  2091  protein of unknown function DUF214  YP_003142338  hitchhiker  0.00569869  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1757  CDS  NC_013164  16930  18546  1617  ABC transporter related  YP_003142339  normal  0.0110812  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1758  CDS  NC_013164  19005  20336  1332  Relaxase/mobilization nuclease family protein  YP_003142340  normal  0.562908  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1759  CDS  NC_013164  20338  20694  357  hypothetical protein  YP_003142341  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1760  CDS  NC_013164  21067  21438  372  transcriptional regulator, MarR family  YP_003142342  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1761  CDS  NC_013164  21601  22353  753  Thioesterase  YP_003142343  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1762  CDS  NC_013164  22343  23035  693  4'-phosphopantetheinyl transferase  YP_003142344  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1763  CDS  NC_013164  23035  24621  1587  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_003142345  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1764  CDS  NC_013164  24634  29127  4494  amino acid adenylation domain protein  YP_003142346  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1765  CDS  NC_013164  29124  31295  2172  oxidoreductase domain protein  YP_003142347  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1766  CDS  NC_013164  31299  34064  2766  condensation domain protein  YP_003142348  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1767  CDS  NC_013164  34057  35001  945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003142349  normal  0.423798  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1768  CDS  NC_013164  35001  35777  777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003142350  normal  0.601934  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1769  CDS  NC_013164  35782  36564  783  ABC transporter related  YP_003142351  normal  0.611279  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1770  CDS  NC_013164  36552  37256  705  ABC transporter related  YP_003142352  normal  0.529989  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1771  CDS  NC_013164  37259  38902  1644  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003142353  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1772  CDS  NC_013164  38978  39646  669  lysophospholipase-like protein  YP_003142354  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1773  CDS  NC_013164  39659  41380  1722  ABC transporter related  YP_003142355  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1774  CDS  NC_013164  41373  43109  1737  ABC transporter related  YP_003142356  normal  0.937186  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1775  CDS  NC_013164  43419  43556  138  hypothetical protein  YP_003142357  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1776  CDS  NC_013164  43612  45432  1821  resolvase domain protein  YP_003142358  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1777  CDS  NC_013164  45317  45670  354  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  YP_003142359  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1778    NC_013164  45878  46084  207      normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1779    NC_013164  46183  46977  795      normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1780  CDS  NC_013164  47376  47855  480  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  YP_003142360  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1781  CDS  NC_013164  47922  48251  330  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  YP_003142361  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1782    NC_013164  48451  48643  193      normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1783  CDS  NC_013164  48654  49430  777  Methyltransferase type 11  YP_003142362  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1784    NC_013164  49517  49678  162      normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1785  CDS  NC_013164  49762  50292  531  hypothetical protein  YP_003142363  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1786    NC_013164  50513  50643  131      normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1787  CDS  NC_013164  50773  51063  291  hypothetical protein  YP_003142364  normal  0.969809  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1788  CDS  NC_013164  51398  53032  1635  MobA/MobL protein  YP_003142365  normal  0.96066  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1789  CDS  NC_013164  53106  53279  174  hypothetical protein  YP_003142366  normal  0.855646  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1790  CDS  NC_013164  53654  54502  849  transcriptional regulator, AraC family  YP_003142367  normal  0.191731  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1791  CDS  NC_013164  54587  54718  132  hypothetical protein  YP_003142368  normal  0.1575  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1792  CDS  NC_013164  54794  55180  387  hypothetical protein  YP_003142369  normal  0.143344  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1793  CDS  NC_013164  55426  56160  735  phage replisome organizer  YP_003142370  normal  0.128915  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1794  CDS  NC_013164  56847  57008  162  hypothetical protein  YP_003142371  normal  0.76803  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1795  CDS  NC_013164  57106  58782  1677  resolvase domain protein  YP_003142372  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1796    NC_013164  58785  58937  153      normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1797  CDS  NC_013164  59104  59691  588  hypothetical protein  YP_003142373  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1798  CDS  NC_013164  59838  60440  603  transcriptional regulator, AraC family  YP_003142374  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1799  CDS  NC_013164  60592  60828  237  transcriptional regulator, XRE family  YP_003142375  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1800  CDS  NC_013164  60831  61949  1119  hypothetical protein  YP_003142376  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1801  CDS  NC_013164  62107  62880  774  replication initiator A domain protein  YP_003142377  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1802  CDS  NC_013164  62877  63704  828  hypothetical protein  YP_003142378  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1803  CDS  NC_013164  63697  64182  486  hypothetical protein  YP_003142379  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1804  CDS  NC_013164  64179  64913  735  prophage antirepressor  YP_003142380  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1805  CDS  NC_013164  64906  66702  1797  TRAG family protein  YP_003142381  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1806  CDS  NC_013164  66721  66996  276  hypothetical protein  YP_003142382  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1807    NC_013164  67034  67464  431      normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1808  CDS  NC_013164  67517  67897  381  hypothetical protein  YP_003142383  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1809  CDS  NC_013164  67897  68235  339  hypothetical protein  YP_003142384  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1810  CDS  NC_013164  68426  68737  312  hypothetical protein  YP_003142385  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1811  CDS  NC_013164  68739  68954  216  hypothetical protein  YP_003142386  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1812  CDS  NC_013164  68965  69828  864  hypothetical protein  YP_003142387  normal  0.688219  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1813  CDS  NC_013164  69838  70128  291  hypothetical protein  YP_003142388  normal  0.886907  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1814  CDS  NC_013164  70130  70540  411  hypothetical protein  YP_003142389  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1815  CDS  NC_013164  70611  72854  2244  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  YP_003142390  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1816  CDS  NC_013164  72862  75441  2580  NLP/P60 protein  YP_003142391  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1817  CDS  NC_013164  75456  75695  240  hypothetical protein  YP_003142392  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1818  CDS  NC_013164  75682  77265  1584  copper amine oxidase domain protein  YP_003142393  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1819  CDS  NC_013164  77280  78143  864  hypothetical protein  YP_003142394  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1820  CDS  NC_013164  78217  78828  612  hypothetical protein  YP_003142395  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1821  CDS  NC_013164  78821  79804  984  hypothetical protein  YP_003142396  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1822  CDS  NC_013164  79893  81614  1722  DNA topoisomerase type IA central domain protein  YP_003142397  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1823  CDS  NC_013164  81607  82572  966  DNA-cytosine methyltransferase  YP_003142398  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1824  CDS  NC_013164  82559  88855  6297  helicase domain protein  YP_003142399  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1825  CDS  NC_013164  89411  91081  1671  RNA-directed DNA polymerase  YP_003142400  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1826  CDS  NC_013164  91215  92543  1329  hypothetical protein  YP_003142401  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1827  CDS  NC_013164  92587  93243  657  hypothetical protein  YP_003142402  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1828  CDS  NC_013164  93859  94329  471  hypothetical protein  YP_003142403  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1829  CDS  NC_013164  94352  94873  522  hypothetical protein  YP_003142404  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1830  CDS  NC_013164  94876  95100  225  transcriptional regulator, XRE family  YP_003142405  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1831  CDS  NC_013164  95181  95453  273  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  YP_003142406  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1832    NC_013164  95850  96019  170      normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1833  CDS  NC_013164  96369  97052  684  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_003142407  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1834  CDS  NC_013164  97045  98091  1047  histidine kinase  YP_003142408  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1835  CDS  NC_013164  98311  99198  888  ABC transporter related  YP_003142409  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1836  CDS  NC_013164  99200  100480  1281  hypothetical protein  YP_003142410  normal  0.908169  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1837  CDS  NC_013164  100440  101996  1557  Radical SAM domain protein  YP_003142411  normal  0.654863  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1838  CDS  NC_013164  102064  102261  198  hypothetical protein  YP_003142412  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1839  CDS  NC_013164  102383  103612  1230  hypothetical protein  YP_003142413  normal  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>