32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1797 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013164  Apre_1797  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  394  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0679  hypothetical protein  92.31 
 
 
195 aa  365  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0556  hypothetical protein  36.46 
 
 
196 aa  128  6e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000356919 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  31.79 
 
 
201 aa  123  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1284  abortive infection protein AbiGI  32.64 
 
 
196 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13950  hypothetical protein  28.11 
 
 
194 aa  107  9.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0786  hypothetical protein  27.23 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.232716  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  26.09 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  25.93 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  26.88 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3271  hypothetical protein  25.71 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25030  hypothetical protein  23.83 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4515  hypothetical protein  24.53 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  22.8 
 
 
202 aa  62  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  26.11 
 
 
197 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  23.28 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3170  hypothetical protein  23.53 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.175438  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5577  hypothetical protein  21.55 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0490  hypothetical protein  28.92 
 
 
89 aa  56.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.3339  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0555  hypothetical protein  22.96 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0912  hypothetical protein  20.97 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.396439  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  23.81 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01414  hypothetical protein  23.47 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  25 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  28.47 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5648  hypothetical protein  21.56 
 
 
205 aa  48.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693813  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2875  hypothetical protein  23.16 
 
 
184 aa  48.5  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3053  hypothetical protein  32.53 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.634225  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2055  hypothetical protein  22.28 
 
 
200 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0083  hypothetical protein  20 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22770  hypothetical protein  24.74 
 
 
303 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.513597  normal  0.79035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3048  hypothetical protein  22.16 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>