30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0556 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0556  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  393  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000356919 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0679  hypothetical protein  38.02 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1797  hypothetical protein  36.46 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13950  hypothetical protein  34.5 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  28.06 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1284  abortive infection protein AbiGI  30.93 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  29.19 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  28.41 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0786  hypothetical protein  27.27 
 
 		 203 aa  67  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.232716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  28 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3271  hypothetical protein  25.52 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  28.07 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  31.45 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0490  hypothetical protein  37.66 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.3339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  30.06 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  24.29 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3170  hypothetical protein  26.29 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.175438  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0912  hypothetical protein  23.56 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.396439  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5648  hypothetical protein  25.31 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693813  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  23.26 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6555  hypothetical protein  23.04 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0940504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  22.03 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  30.77 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0491  hypothetical protein  36.67 
 
 		 106 aa  48.5  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.170346  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  22.99 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2875  hypothetical protein  28.21 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0083  hypothetical protein  22.99 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01414  hypothetical protein  24.57 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4515  hypothetical protein  25.5 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0555  hypothetical protein  22.46 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.618914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>