39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1304 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  67.51 
 
 
197 aa  293  9e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  61.83 
 
 
203 aa  240  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  60.43 
 
 
203 aa  240  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0786  hypothetical protein  58.82 
 
 
203 aa  237  9e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.232716  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  59.36 
 
 
204 aa  236  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  58.82 
 
 
203 aa  235  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2854  hypothetical protein  52.28 
 
 
232 aa  188  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  46.74 
 
 
200 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2055  hypothetical protein  46.2 
 
 
200 aa  167  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0555  hypothetical protein  50.88 
 
 
199 aa  167  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01414  hypothetical protein  48.9 
 
 
199 aa  164  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  43.96 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0912  hypothetical protein  45.86 
 
 
207 aa  161  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.396439  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  43.96 
 
 
202 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5648  hypothetical protein  45.05 
 
 
205 aa  151  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0083  hypothetical protein  46.11 
 
 
204 aa  150  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6555  hypothetical protein  39.79 
 
 
206 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0940504  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3048  hypothetical protein  38.33 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3271  hypothetical protein  34.2 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  37.36 
 
 
205 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  36.26 
 
 
205 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4243  hypothetical protein  39.41 
 
 
234 aa  118  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5577  hypothetical protein  35.42 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3170  hypothetical protein  37.01 
 
 
185 aa  94.7  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.175438  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4515  hypothetical protein  32.43 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2875  hypothetical protein  31.17 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0556  hypothetical protein  30.06 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000356919 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  28.05 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0679  hypothetical protein  25.41 
 
 
195 aa  54.7  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1284  abortive infection protein AbiGI  27.87 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1797  hypothetical protein  25 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13950  hypothetical protein  22.96 
 
 
194 aa  48.5  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0490  hypothetical protein  37.31 
 
 
89 aa  47.4  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.3339  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  32.03 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4390  transcriptional regulator-like protein  25.73 
 
 
276 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  28.24 
 
 
276 aa  45.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4909  transcriptional regulator protein-like protein  29.23 
 
 
276 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2938  hypothetical protein  27.69 
 
 
277 aa  41.6  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>