22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4390 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4390  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 
276 aa  570  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4998  transcriptional regulator-like protein  33.08 
 
 
276 aa  165  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1882  hypothetical protein  33.08 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  28.46 
 
 
276 aa  106  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4909  transcriptional regulator protein-like protein  29 
 
 
276 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1880  ORF H1617  27.82 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.851213  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2938  hypothetical protein  25.91 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0815  ORF H1617  28.96 
 
 
270 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3303  transcriptional regulator protein-like protein  25.47 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102751  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0195  hypothetical protein  26.42 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0262  hypothetical protein  26.73 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4887  hypothetical protein  24.45 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3348  hypothetical protein  24.2 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1417  hypothetical protein  23.95 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0513  hypothetical protein  24.81 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.891131  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0714  hypothetical protein  24.82 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2737  hypothetical protein  22.94 
 
 
213 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.683361 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  25.73 
 
 
197 aa  45.8  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0067  hypothetical protein  23.2 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3800  hypothetical protein  22.22 
 
 
217 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0544747  normal  0.583558 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1150  hypothetical protein  23.68 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0190  hypothetical protein  19.54 
 
 
222 aa  42.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.155652  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>