16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0815 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0815  ORF H1617  100 
 
 		 270 aa  550  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1880  ORF H1617  42.15 
 
 		 272 aa  218  8.999999999999998e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.851213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4998  transcriptional regulator-like protein  32.35 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1882  hypothetical protein  30.22 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2938  hypothetical protein  30.04 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  31.42 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4909  transcriptional regulator protein-like protein  31.39 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4390  transcriptional regulator-like protein  28.96 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3303  transcriptional regulator protein-like protein  31.28 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3348  hypothetical protein  29.67 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1611  hypothetical protein  26.12 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11420  hypothetical protein  26.27 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.987081  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0195  hypothetical protein  23.27 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0262  hypothetical protein  28.24 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0826  hypothetical protein  23.45 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  25.64 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>