13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1882 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1882  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  553  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4998  transcriptional regulator-like protein  61.34 
 
 
276 aa  354  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4390  transcriptional regulator-like protein  33.08 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  29.74 
 
 
276 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4909  transcriptional regulator protein-like protein  28.46 
 
 
276 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2938  hypothetical protein  27.24 
 
 
277 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0815  ORF H1617  30.22 
 
 
270 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1880  ORF H1617  33.2 
 
 
272 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.851213  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3303  transcriptional regulator protein-like protein  26.07 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102751  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0195  hypothetical protein  24.3 
 
 
274 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11420  hypothetical protein  25.13 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.987081  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0067  hypothetical protein  21.89 
 
 
261 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0262  hypothetical protein  23.68 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>