23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3119 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4909  transcriptional regulator protein-like protein  79.35 
 
 		 276 aa  453  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2938  hypothetical protein  57.82 
 
 		 277 aa  335  5e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4998  transcriptional regulator-like protein  30.45 
 
 		 276 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1882  hypothetical protein  29.74 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1880  ORF H1617  31.18 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.851213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4390  transcriptional regulator-like protein  28.46 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0815  ORF H1617  31.42 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3303  transcriptional regulator protein-like protein  29.41 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0195  hypothetical protein  20.95 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  26.55 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  27.34 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  25.76 
 
 		 202 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  28.66 
 
 		 200 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2055  hypothetical protein  27.85 
 
 		 200 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0714  hypothetical protein  24.46 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1150  hypothetical protein  24.71 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0826  hypothetical protein  27.92 
 
 		 194 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  26.76 
 
 		 205 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  28.24 
 
 		 197 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0262  hypothetical protein  25.43 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1417  hypothetical protein  25.88 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3048  hypothetical protein  27.5 
 
 		 187 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>