32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3048 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3048  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6555  hypothetical protein  75.94 
 
 		 206 aa  289  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0940504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0555  hypothetical protein  48.9 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  48.9 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01414  hypothetical protein  47.8 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  47.25 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5648  hypothetical protein  45.65 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2055  hypothetical protein  46.7 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0083  hypothetical protein  45.65 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  46.15 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  37.91 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  39.01 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  35.36 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  35.36 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  35.36 
 
 		 203 aa  137  8.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  35.36 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0786  hypothetical protein  34.81 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.232716  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0912  hypothetical protein  36.26 
 
 		 207 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.396439  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  38.33 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  32.42 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3271  hypothetical protein  32.42 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4243  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5577  hypothetical protein  33.15 
 
 		 204 aa  85.5  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4515  hypothetical protein  34.44 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3170  hypothetical protein  37.98 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.175438  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2875  hypothetical protein  30.72 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2854  hypothetical protein  35.29 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4909  transcriptional regulator protein-like protein  30.56 
 
 		 276 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1797  hypothetical protein  22.16 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3303  transcriptional regulator protein-like protein  28.9 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1225  hypothetical protein  29.58 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  27.5 
 
 		 276 aa  42  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>