32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4515 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4515  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3170  hypothetical protein  41.44 
 
 
185 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.175438  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2875  hypothetical protein  41.71 
 
 
184 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  32.93 
 
 
203 aa  97.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5577  hypothetical protein  37.66 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  33.77 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  33.76 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  33.11 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0786  hypothetical protein  33.11 
 
 
203 aa  88.6  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.232716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  31.79 
 
 
203 aa  87.8  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  32.43 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  34.44 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  32.14 
 
 
202 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  31.61 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3271  hypothetical protein  27.53 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3048  hypothetical protein  34.44 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0912  hypothetical protein  31.97 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.396439  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4243  hypothetical protein  31.43 
 
 
234 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0083  hypothetical protein  29.63 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0555  hypothetical protein  35 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0679  hypothetical protein  26.04 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01414  hypothetical protein  33.57 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1797  hypothetical protein  24.53 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6555  hypothetical protein  36 
 
 
206 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0940504  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  28.87 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2854  hypothetical protein  38.75 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2055  hypothetical protein  28.3 
 
 
200 aa  58.2  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5648  hypothetical protein  29.29 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  29.5 
 
 
200 aa  51.2  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  23.27 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25030  hypothetical protein  26.82 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0556  hypothetical protein  25.5 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000356919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>