13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25030 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_25030  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3085  hypothetical protein  45.69 
 
 
208 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0679  hypothetical protein  23.15 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22770  hypothetical protein  27.98 
 
 
303 aa  65.1  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.513597  normal  0.79035 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1797  hypothetical protein  23.83 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5471  hypothetical protein  27.49 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.927371  normal  0.730632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22570  hypothetical protein  31.41 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  32.78 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4917  hypothetical protein  31.82 
 
 
224 aa  52  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3053  hypothetical protein  30 
 
 
196 aa  45.8  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.634225  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  26.63 
 
 
201 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4515  hypothetical protein  26.82 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  28.32 
 
 
197 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>