13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3085 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3085  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25030  hypothetical protein  45.69 
 
 
229 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5471  hypothetical protein  31.79 
 
 
230 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.927371  normal  0.730632 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4917  hypothetical protein  31.68 
 
 
224 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22770  hypothetical protein  24.26 
 
 
303 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.513597  normal  0.79035 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1071  hypothetical protein  29.89 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3281  hypothetical protein  28.99 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  28.32 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3053  hypothetical protein  43.08 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.634225  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22570  hypothetical protein  24.18 
 
 
237 aa  45.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0679  hypothetical protein  21.39 
 
 
195 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  32.72 
 
 
310 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2561  hypothetical protein  29.45 
 
 
285 aa  41.2  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.0508989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>