29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4243 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4243  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  477  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2055  hypothetical protein  38.22 
 
 
200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  35.57 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01414  hypothetical protein  35.79 
 
 
199 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0555  hypothetical protein  34.54 
 
 
199 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0083  hypothetical protein  34.5 
 
 
204 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  39.41 
 
 
197 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0912  hypothetical protein  32.49 
 
 
207 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.396439  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  32.14 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  35.76 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  32.14 
 
 
203 aa  116  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0786  hypothetical protein  31.63 
 
 
203 aa  115  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.232716  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3271  hypothetical protein  31.72 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  30.93 
 
 
202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  31.63 
 
 
202 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  31.11 
 
 
205 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  31.28 
 
 
203 aa  108  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  33.15 
 
 
203 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  30 
 
 
205 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5648  hypothetical protein  36.48 
 
 
205 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693813  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3048  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6555  hypothetical protein  31.55 
 
 
206 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0940504  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4515  hypothetical protein  31.43 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3170  hypothetical protein  31.95 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.175438  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2854  hypothetical protein  28.24 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2875  hypothetical protein  29.56 
 
 
184 aa  59.3  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5577  hypothetical protein  26.38 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13950  hypothetical protein  25.58 
 
 
194 aa  50.4  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  24.02 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>