26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13950 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_13950  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0556  hypothetical protein  34.5 
 
 
196 aa  111  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000356919 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1797  hypothetical protein  28.11 
 
 
195 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0679  hypothetical protein  27.03 
 
 
195 aa  106  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  31.98 
 
 
201 aa  101  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1284  abortive infection protein AbiGI  30.05 
 
 
196 aa  100  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  26.7 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  26.5 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0786  hypothetical protein  24.48 
 
 
203 aa  67  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.232716  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0490  hypothetical protein  36.05 
 
 
89 aa  67.4  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.3339  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  28.06 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  24.61 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  24.08 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3271  hypothetical protein  21.54 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  23.12 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  29.41 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  23.83 
 
 
205 aa  51.2  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4243  hypothetical protein  25.58 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  26.88 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  22.96 
 
 
197 aa  48.5  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0491  hypothetical protein  30.95 
 
 
106 aa  45.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.170346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0083  hypothetical protein  26.53 
 
 
204 aa  45.1  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01414  hypothetical protein  27.33 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0555  hypothetical protein  35.24 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  21.76 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2055  hypothetical protein  24.62 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>