38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5453 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  82.93 
 
 		 205 aa  357  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6555  hypothetical protein  47.32 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0940504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3048  hypothetical protein  48.9 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01414  hypothetical protein  50 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0555  hypothetical protein  49.46 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2055  hypothetical protein  45.74 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  40.8 
 
 		 202 aa  168  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  47.31 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  40.8 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0912  hypothetical protein  41.94 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.396439  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5648  hypothetical protein  41.33 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0083  hypothetical protein  41.94 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  34.83 
 
 		 203 aa  144  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0786  hypothetical protein  34.76 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.232716  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  34.55 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  33.83 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  34.22 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  37.36 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  33.88 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4243  hypothetical protein  30 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5577  hypothetical protein  28.18 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4515  hypothetical protein  34.44 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3170  hypothetical protein  31.89 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.175438  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2854  hypothetical protein  28.65 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2875  hypothetical protein  28.83 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1284  abortive infection protein AbiGI  20.83 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0556  hypothetical protein  24.29 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000356919 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4909  transcriptional regulator protein-like protein  30.23 
 
 		 276 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13950  hypothetical protein  23.83 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  27.34 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  25.25 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22770  hypothetical protein  30.97 
 
 		 303 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.513597  normal  0.79035 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  27.86 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  35.56 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  35.56 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  35.56 
 
 		 243 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>