34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2875 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2875  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3170  hypothetical protein  42.47 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.175438  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4515  hypothetical protein  41.71 
 
 
193 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5577  hypothetical protein  39.34 
 
 
204 aa  99  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  28.48 
 
 
197 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  32.39 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0786  hypothetical protein  29.93 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.232716  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  29.93 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  30.41 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0912  hypothetical protein  30.2 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.396439  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  31.17 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  29.25 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5648  hypothetical protein  33.81 
 
 
205 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693813  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  28.95 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3271  hypothetical protein  25.42 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0083  hypothetical protein  32.62 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  31.82 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3048  hypothetical protein  30.72 
 
 
187 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  27.34 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2055  hypothetical protein  28.9 
 
 
200 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4243  hypothetical protein  29.56 
 
 
234 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  28.83 
 
 
205 aa  57.8  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  28.9 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0679  hypothetical protein  24.74 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01414  hypothetical protein  30.14 
 
 
199 aa  55.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0555  hypothetical protein  30.28 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6555  hypothetical protein  30.07 
 
 
206 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0940504  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1284  abortive infection protein AbiGI  25.79 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2854  hypothetical protein  37.78 
 
 
232 aa  51.2  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1797  hypothetical protein  23.16 
 
 
195 aa  48.5  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0556  hypothetical protein  28.21 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000356919 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  27.86 
 
 
201 aa  44.7  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  36.46 
 
 
285 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  37.08 
 
 
285 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>