17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4998 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4998  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 276 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1882  hypothetical protein  61.34 
 
 		 271 aa  354  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4390  transcriptional regulator-like protein  33.08 
 
 		 276 aa  165  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4909  transcriptional regulator protein-like protein  29.96 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  30.45 
 
 		 276 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2938  hypothetical protein  27.27 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0815  ORF H1617  32.35 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1880  ORF H1617  32.08 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.851213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3303  transcriptional regulator protein-like protein  27.55 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0195  hypothetical protein  25.1 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0826  hypothetical protein  24.03 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0714  hypothetical protein  32.54 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0513  hypothetical protein  26.4 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.891131  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11420  hypothetical protein  26.2 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.987081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1417  hypothetical protein  23.85 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0262  hypothetical protein  26.34 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3348  hypothetical protein  32.17 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>