2707 genes were found for organism Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 28    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bcen2424_3167  CDS  NC_008543  220  417  -  198  hypothetical protein  YP_836807  normal  1  normal  0.2993  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3168  CDS  NC_008543  717  2378  -  1662  malate:quinone oxidoreductase  YP_836808  normal  1  normal  0.366613  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3169  CDS  NC_008543  2898  3218  -  321  hypothetical protein  YP_836809  normal  1  normal  0.187601  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3170    NC_008543  3383  3538  +  156      normal  1  normal  0.0942262  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3171  CDS  NC_008543  3573  4538  -  966  MscS mechanosensitive ion channel  YP_836810  normal  1  normal  0.10941  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3172  CDS  NC_008543  4723  6096  +  1374  peptidase M23B  YP_836811  normal  1  normal  0.054891  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3173  CDS  NC_008543  6422  7519  +  1098  catalase domain-containing protein  YP_836812  normal  1  normal  0.0198866  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3174  CDS  NC_008543  7516  8082  +  567  cytochrome B561  YP_836813  normal  1  normal  0.0189588  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3175  CDS  NC_008543  8624  11905  +  3282  outer membrane autotransporter  YP_836814  normal  1  normal  0.0115385  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3176  CDS  NC_008543  12063  12797  -  735  fucose-binding lectin II  YP_836815  normal  1  decreased coverage  0.00638725  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3177  CDS  NC_008543  12960  13778  -  819  fucose-binding lectin II  YP_836816  normal  1  normal  0.0525996  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3178  CDS  NC_008543  13893  14282  -  390  fucose-binding lectin II  YP_836817  normal  1  normal  0.110045  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3179  CDS  NC_008543  15239  16951  +  1713  2-isopropylmalate synthase  YP_836818  normal  1  normal  0.1313  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3180  CDS  NC_008543  17023  17736  -  714  LuxR family transcriptional regulator  YP_836819  normal  1  normal  0.100011  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3181  CDS  NC_008543  17933  18748  +  816  AraC family transcriptional regulator  YP_836820  normal  1  normal  0.200885  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3182  CDS  NC_008543  18772  20118  -  1347  hypothetical protein  YP_836821  normal  1  normal  0.224381  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3183  CDS  NC_008543  20175  21536  -  1362  condensation domain-containing protein  YP_836822  normal  1  normal  0.653152  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3184  CDS  NC_008543  21934  22716  +  783  hypothetical protein  YP_836823  normal  1  normal  0.375006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3185  CDS  NC_008543  22713  23102  +  390  cupin 2 domain-containing protein  YP_836824  normal  1  normal  0.56553  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3186  CDS  NC_008543  23099  24025  +  927  hypothetical protein  YP_836825  normal  1  normal  0.934686  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3187  CDS  NC_008543  24035  27601  +  3567  amino acid adenylation domain-containing protein  YP_836826  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3188  CDS  NC_008543  27657  28145  +  489  hypothetical protein  YP_836827  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3189  CDS  NC_008543  28174  29160  -  987  LysR family transcriptional regulator  YP_836828  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3190  CDS  NC_008543  29280  30113  -  834  AraC family transcriptional regulator  YP_836829  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3191  CDS  NC_008543  30170  31663  +  1494  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_836830  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3192  CDS  NC_008543  31723  32847  +  1125  secretion protein HlyD family protein  YP_836831  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3193  CDS  NC_008543  32844  34427  +  1584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_836832  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3194  CDS  NC_008543  34627  34962  +  336  ArsR family transcriptional regulator  YP_836833  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3195  CDS  NC_008543  34959  35477  +  519  protein tyrosine phosphatase  YP_836834  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3196  CDS  NC_008543  35486  36613  +  1128  arsenical-resistance protein  YP_836835  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3197  CDS  NC_008543  36661  37401  +  741  NADPH-dependent FMN reductase  YP_836836  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3198  CDS  NC_008543  37732  39177  +  1446  histidine kinase  YP_836837  normal  0.474153  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3199  CDS  NC_008543  39174  39818  +  645  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_836838  normal  0.529866  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3200  CDS  NC_008543  40097  40876  +  780  carbonate dehydratase  YP_836839  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3201  CDS  NC_008543  40990  41700  +  711  porin, opacity type  YP_836840  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3202  CDS  NC_008543  41791  42810  +  1020  hypothetical protein  YP_836841  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3203  CDS  NC_008543  42807  43475  +  669  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  YP_836842  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3204  CDS  NC_008543  43760  45265  +  1506  integrase catalytic subunit  YP_836843  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3205  CDS  NC_008543  45258  46055  +  798  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_836844  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3206  CDS  NC_008543  46105  46641  -  537  NmrA family protein  YP_836845  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3207  CDS  NC_008543  46823  47740  -  918  hypothetical protein  YP_836846  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3208  CDS  NC_008543  47840  48751  +  912  LysR family transcriptional regulator  YP_836847  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3209  CDS  NC_008543  49093  50340  -  1248  citrate synthase  YP_836848  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3210  CDS  NC_008543  50401  50793  -  393  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_836849  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3211  CDS  NC_008543  50841  52127  -  1287  major facilitator transporter  YP_836850  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3212  CDS  NC_008543  52222  52980  -  759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_836851  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3213  CDS  NC_008543  53294  54256  +  963  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  YP_836852  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3214  CDS  NC_008543  54801  55946  +  1146  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  YP_836853  normal  1  normal  0.843392  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3215  CDS  NC_008543  56029  57351  +  1323  major facilitator transporter  YP_836854  normal  1  normal  0.846569  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3216  CDS  NC_008543  57495  58202  -  708  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_836855  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3217  CDS  NC_008543  58227  58523  -  297  hypothetical protein  YP_836856  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3218  CDS  NC_008543  58603  59409  -  807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_836857  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3219  CDS  NC_008543  59748  60842  +  1095  AraC family transcriptional regulator  YP_836858  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3220  CDS  NC_008543  61126  61530  -  405  hypothetical protein  YP_836859  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3221  CDS  NC_008543  61564  62529  -  966  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  YP_836860  normal  1  normal  0.865641  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3222  CDS  NC_008543  62692  63609  -  918  LysR family transcriptional regulator  YP_836861  normal  1  normal  0.937901  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3223  CDS  NC_008543  63747  64511  +  765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_836862  normal  1  normal  0.907377  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3224  CDS  NC_008543  64595  65302  +  708  pirin domain-containing protein  YP_836863  normal  1  normal  0.911223  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3225  CDS  NC_008543  65670  65927  -  258  hypothetical protein  YP_836864  normal  1  normal  0.855518  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3226  CDS  NC_008543  66065  67009  -  945  LysR family transcriptional regulator  YP_836865  normal  1  normal  0.56553  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3227  CDS  NC_008543  67191  68114  +  924  dihydrodipicolinate synthetase  YP_836866  normal  1  normal  0.535768  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3228  CDS  NC_008543  68351  69793  +  1443  major facilitator transporter  YP_836867  normal  1  normal  0.325137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3229  CDS  NC_008543  69984  71057  +  1074  porin  YP_836868  normal  1  normal  0.484687  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3230  CDS  NC_008543  71289  71417  -  129  AraC family transcriptional regulator  YP_836869  normal  1  normal  0.429699  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3231    NC_008543  71447  71734  -  288      normal  1  normal  0.441915  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3232  CDS  NC_008543  71783  73180  +  1398  integrase catalytic subunit  YP_836870  normal  1  normal  0.495092  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3233  CDS  NC_008543  73334  73708  -  375  putative transposase protein  YP_836871  normal  1  normal  0.429699  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3234  CDS  NC_008543  73762  74070  -  309  transposase IS3/IS911 family protein  YP_836872  normal  1  normal  0.425434  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3235  CDS  NC_008543  74109  74234  +  126  hypothetical protein  YP_836873  normal  1  normal  0.420046  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3236  CDS  NC_008543  74441  75178  -  738  hypothetical protein  YP_836874  normal  1  normal  0.711093  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3237  CDS  NC_008543  75454  76029  -  576  hypothetical protein  YP_836875  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3238  CDS  NC_008543  76026  76253  -  228  hypothetical protein  YP_836876  normal  1  normal  0.682937  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3239  CDS  NC_008543  76444  76779  +  336  hypothetical protein  YP_836877  normal  1  normal  0.695454  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3240  CDS  NC_008543  76866  77222  -  357  hypothetical protein  YP_836878  normal  1  normal  0.71416  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3241  CDS  NC_008543  77415  78587  -  1173  porin  YP_836879  normal  1  normal  0.535768  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3242  CDS  NC_008543  78662  80011  -  1350  major facilitator transporter  YP_836880  normal  1  normal  0.531271  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3243  CDS  NC_008543  80335  80619  -  285  hypothetical protein  YP_836881  normal  0.515548  normal  0.482098  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3244  CDS  NC_008543  80715  81692  +  978  AraC family transcriptional regulator  YP_836882  normal  0.515749  normal  0.506544  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3245  CDS  NC_008543  81908  84622  +  2715  2-oxoacid dehydrogenase subunit E1  YP_836883  normal  0.633638  normal  0.656536  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3246  CDS  NC_008543  84758  86119  +  1362  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  YP_836884  normal  1  normal  0.581688  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3247  CDS  NC_008543  86394  88181  +  1788  dihydrolipoamide dehydrogenase  YP_836885  normal  1  normal  0.639352  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3248  CDS  NC_008543  88337  88939  +  603  AsnC family transcriptional regulator  YP_836886  normal  0.157237  normal  0.560718  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3249  CDS  NC_008543  88962  90110  +  1149  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  YP_836887  normal  0.0542314  normal  0.613988  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3250  CDS  NC_008543  90312  91949  +  1638  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_836888  normal  0.0550813  normal  0.598947  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3251  CDS  NC_008543  91987  92808  -  822  AraC family transcriptional regulator  YP_836889  normal  0.404361  normal  0.350151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3252  CDS  NC_008543  93027  93791  +  765  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_836890  normal  1  normal  0.348513  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3253  CDS  NC_008543  93794  94573  +  780  creatininase  YP_836891  normal  1  normal  0.340284  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3254  CDS  NC_008543  94864  96018  +  1155  luciferase family protein  YP_836892  normal  1  normal  0.354968  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3255  CDS  NC_008543  96023  96811  +  789  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_836893  normal  1  normal  0.574629  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3256  CDS  NC_008543  96808  98715  +  1908  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_836894  normal  1  normal  0.653152  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3257  CDS  NC_008543  98806  99387  +  582  flavin reductase domain-containing protein  YP_836895  normal  1  normal  0.347082  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3258  CDS  NC_008543  99641  101440  +  1800  integrase catalytic subunit  YP_836896  normal  1  normal  0.246577  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3259  CDS  NC_008543  101450  102319  +  870  TniB family protein  YP_836897  normal  1  normal  0.112641  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3260  CDS  NC_008543  102300  102824  +  525  hypothetical protein  YP_836898  normal  1  normal  0.110628  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3261  CDS  NC_008543  102833  103174  +  342  hypothetical protein  YP_836899  normal  1  normal  0.104283  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3262  CDS  NC_008543  103261  103479  -  219  4-oxalocrotonate tautomerase  YP_836900  normal  1  normal  0.104892  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3263  CDS  NC_008543  103538  104746  -  1209  aminotransferase, class I and II  YP_836901  normal  1  normal  0.0613421  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3264  CDS  NC_008543  105127  106236  -  1110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_836902  normal  1  normal  0.126582  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3265  CDS  NC_008543  106385  107065  -  681  DSBA oxidoreductase  YP_836903  normal  1  normal  0.22208  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3266  CDS  NC_008543  107135  107476  -  342  alkylhydroperoxidase  YP_836904  normal  1  normal  0.214246  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 28    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>