19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3177 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4983  fucose-binding lectin II  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3177  fucose-binding lectin II  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0525996 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4302  fucose-binding lectin II  94.12 
 
 		 271 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal  0.0766274 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2934  hypothetical protein  85.16 
 
 		 283 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2935  hypothetical protein  70.49 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575987  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5108  fucose-binding lectin II  71.3 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00609809  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3258  fucose-binding lectin II  70.43 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000492866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4984  fucose-binding lectin II  71.19 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3176  fucose-binding lectin II  71.19 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00638725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4303  fucose-binding lectin II  71.19 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.729545  normal  0.0282689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3288  hypothetical protein  52.63 
 
 		 114 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20610  fucose-binding lectin PA-IIL  43.36 
 
 		 115 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000165307  normal  0.65706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1769  fucose-binding lectin PA-IIL  41.59 
 
 		 115 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7213  hypothetical protein  41.38 
 
 		 296 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2933  hypothetical protein  44.26 
 
 		 129 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.706897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4301  fucose-binding lectin II  44.26 
 
 		 129 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.886419  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3178  fucose-binding lectin II  44.26 
 
 		 129 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4982  hypothetical protein  44.26 
 
 		 129 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3259  fucose-binding lectin II  42.31 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0014787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>