24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3184 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4295  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  0.381726 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3184  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4976  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2112  hypothetical protein  47.76 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5009  hypothetical protein  50.65 
 
 		 258 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5455  hypothetical protein  48.92 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0128  hypothetical protein  49.35 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3340  hypothetical protein  42.31 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1289  hypothetical protein  39.68 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2460  hypothetical protein  41.22 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3258  hypothetical protein  42.97 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0774  hypothetical protein  41.83 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3073  hypothetical protein  41.35 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2179  hypothetical protein  43.37 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203025  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04660  hypothetical protein  37.7 
 
 		 258 aa  186  5e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2203  hypothetical protein  40.24 
 
 		 264 aa  185  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.120028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2671  hypothetical protein  39.02 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000402711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2038  hypothetical protein  42.86 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.694865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2488  hypothetical protein  39.02 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1964  hypothetical protein  37.55 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2418  hypothetical protein  40.24 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  0.533481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5564  hypothetical protein  40.08 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1648  hypothetical protein  38.98 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1114  hypothetical protein  36.6 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>