15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3170 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3170    100 
 
 		 156 bp  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4310    92.95 
 
 		 165 bp  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000180481  decreased coverage  0.0000000234617 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  90.54 
 
 		 1146 bp  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  87.67 
 
 		 1134 bp  147  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3255    87.67 
 
 		 720 bp  147  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  86.57 
 
 		 1176 bp  61.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  86.57 
 
 		 1176 bp  61.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  86.57 
 
 		 1143 bp  61.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  85.07 
 
 		 1143 bp  54  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  85.07 
 
 		 1143 bp  54  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0689  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  94.12 
 
 		 969 bp  52  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000923213  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  83.33 
 
 		 1146 bp  48.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  96.3 
 
 		 1155 bp  46.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  83.58 
 
 		 1143 bp  46.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  96.3 
 
 		 1155 bp  46.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>