1874 genes were found for organism Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
HS_0001  CDS  NC_008309  384  1181  798  integrase  YP_718206  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0002  CDS  NC_008309  1927  3324  1398  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  YP_718207  normal  0.485166  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0003  CDS  NC_008309  3401  3865  465  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  YP_718208  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0004  CDS  NC_008309  3990  5450  1461  M20C family Xaa-His dipeptidase  YP_718209  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0005  CDS  NC_008309  5598  8168  2571  DNA mismatch repair protein MutS  YP_718210  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0006  CDS  NC_008309  8310  9125  816  shikimate 5-dehydrogenase  YP_718211  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0007  CDS  NC_008309  9129  9707  579  Sua5 family translation factor  YP_718212  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0008  CDS  NC_008309  9677  10225  549  DNA topoisomerase I-related protein  YP_718213  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0009  CDS  NC_008309  10359  10922  564  hypothetical protein  YP_718214  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0010  CDS  NC_008309  10922  11347  426  Holliday junction resolvase-like protein  YP_718215  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0011  CDS  NC_008309  11348  12106  759  sugar metabolism transcriptional regulator  YP_718216  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0012  CDS  NC_008309  12277  13185  909  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein  YP_718217  normal  0.252631  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0013  CDS  NC_008309  13187  14428  1242  secretion system component  YP_718218  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0014  CDS  NC_008309  14425  15057  633  putative aldolase  YP_718219  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0015  CDS  NC_008309  15060  15836  777  hydroxypyruvate isomerase  YP_718220  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0016  CDS  NC_008309  15963  16910  948  hypothetical protein  YP_718221  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0017  CDS  NC_008309  16926  18398  1473  GntP family permease  YP_718222  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0017a  CDS  NC_008309  18540  18716  177  hypothetical protein  YP_718223  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0018  CDS  NC_008309  19007  20050  1044  hypothetical protein  YP_718224  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0019  CDS  NC_008309  20037  21212  1176  major facilitator superfamily permease  YP_718225  normal  0.284837  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0020  CDS  NC_008309  21510  22280  771  GntR family transcriptional regulator  YP_718226  normal  0.321852  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0021  CDS  NC_008309  22388  23446  1059  Zn-binding dehydrogenase  YP_718227  normal  0.0554419  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0022  CDS  NC_008309  23475  24458  984  dicarboxylate-binding protein  YP_718228  decreased coverage  0.00664942  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0023  CDS  NC_008309  24523  25002  480  permease (transport protein)  YP_718229  normal  0.352968  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0024  CDS  NC_008309  24999  26273  1275  permease (transport protein)  YP_718230  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0025  CDS  NC_008309  26460  27107  648  allophanate hydrolase, subunit 1  YP_718231  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0026  CDS  NC_008309  27104  28033  930  allophanate hydrolase, subunit 2  YP_718232  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0027  CDS  NC_008309  28020  28763  744  LamB/YcsF family protein  YP_718233  normal  0.529091  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0028  CDS  NC_008309  28889  30076  1188  permease (transport protein)  YP_718234  normal  0.37673  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0029  CDS  NC_008309  30320  31048  729  DNA-binding transcriptional regulator AraC  YP_718235  normal  0.773429  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0030  CDS  NC_008309  31236  32210  975  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  YP_718236  normal  0.740399  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0031  CDS  NC_008309  32278  33753  1476  sugar ABC transporter, ATP-binding  YP_718237  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0032  CDS  NC_008309  33722  34696  975  sugar ABC transporter, permease  YP_718238  normal  0.81353  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0033  CDS  NC_008309  34699  35649  951  sugar ABC transporter, permease  YP_718239  normal  0.696552  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0034  CDS  NC_008309  35662  37254  1593  sugar kinase  YP_718240  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0035  CDS  NC_008309  37376  38092  717  peroxiredoxin  YP_718241  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0036  CDS  NC_008309  38221  39135  915  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  YP_718242  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0037  CDS  NC_008309  39262  39657  396  large-conductance mechanosensitive channel  YP_718243  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0038  CDS  NC_008309  39742  41118  1377  potassium transporter peripheral membrane component  YP_718244  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0039  CDS  NC_008309  41203  42591  1389  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  YP_718245  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0040  CDS  NC_008309  42588  43541  954  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_718246  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0041  CDS  NC_008309  43616  44128  513  peptide deformylase  YP_718247  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0042  CDS  NC_008309  44316  44945  630  nitrate/nitrite response regulator protein  YP_718248  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0043  CDS  NC_008309  44960  47470  2511  adenylate cyclase  YP_718249  normal  0.0143533  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0044  CDS  NC_008309  47625  48590  966  porphobilinogen deaminase  YP_718250  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0045  CDS  NC_008309  48677  49345  669  uroporphyrinogen-III synthase  YP_718251  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0046  CDS  NC_008309  49546  50745  1200  uroporphyrin-III C-methyltransferase  YP_718252  normal  0.120112  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0047  CDS  NC_008309  50760  52037  1278  porphyrin biosynthesis protein  YP_718253  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0048  CDS  NC_008309  52092  53078  987  tRNA-dihydrouridine synthase A  YP_718254  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0049  CDS  NC_008309  53491  55044  1554  autoinducer-2 (AI-2) kinase  YP_718255  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0050  CDS  NC_008309  55098  56057  960  sorbitol operon transcriptional regulator  YP_718256  hitchhiker  0.00407862  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0051  CDS  NC_008309  56274  57782  1509  ABC transporter, ATP-binding, sugar transport  YP_718257  decreased coverage  1.86076e-05  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0052  CDS  NC_008309  57791  58789  999  ABC transporter, permease, sugar transport  YP_718258  normal  0.0182601  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0053  CDS  NC_008309  58786  59769  984  ABC transporter, permease, sugar transport  YP_718259  normal  0.201876  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0054  CDS  NC_008309  59882  60901  1020  ABC transporter, solute-binding, sugar transport  YP_718260  normal  0.279397  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0055  CDS  NC_008309  60920  61798  879  aldolase  YP_718261  normal  0.471008  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0056  CDS  NC_008309  61864  62166  303  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  YP_718262  normal  0.140027  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0057  CDS  NC_008309  62159  62869  711  ribulose-phosphate 3-epimerase  YP_718263  hitchhiker  0.00297659  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0058  CDS  NC_008309  63132  63443  312  SSU ribosomal protein S10P  YP_718264  hitchhiker  4.15336e-07  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0059  CDS  NC_008309  63460  64086  627  50S ribosomal protein L3  YP_718265  unclonable  1.58228e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0060  CDS  NC_008309  64102  64704  603  50S ribosomal protein L4  YP_718266  unclonable  1.07913e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0061  CDS  NC_008309  64701  65006  306  50S ribosomal protein L23  YP_718267  unclonable  1.05028e-10  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0062  CDS  NC_008309  65027  65848  822  50S ribosomal protein L2  YP_718268  unclonable  3.94369e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0063  CDS  NC_008309  65875  66150  276  30S ribosomal protein S19  YP_718269  hitchhiker  2.91736e-05  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0064  CDS  NC_008309  66161  66493  333  50S ribosomal protein L22  YP_718270  hitchhiker  0.000121293  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0065  CDS  NC_008309  66510  67217  708  30S ribosomal protein S3  YP_718271  normal  0.0358705  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0066  CDS  NC_008309  67231  67641  411  50S ribosomal protein L16  YP_718272  normal  0.788938  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0067  CDS  NC_008309  67641  67832  192  50S ribosomal protein L29  YP_718273  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0068  CDS  NC_008309  67832  68086  255  30S ribosomal protein S17  YP_718274  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0069  CDS  NC_008309  68283  70889  2607  iron-regulated outer membrane protein  YP_718275  normal  0.024885  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0070  CDS  NC_008309  71086  71457  372  50S ribosomal protein L14  YP_718276  unclonable  1.46326e-10  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0071  CDS  NC_008309  71470  71781  312  50S ribosomal protein L24  YP_718277  decreased coverage  1.98963e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0072  CDS  NC_008309  71799  72338  540  50S ribosomal protein L5  YP_718278  hitchhiker  1.53515e-07  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0073  CDS  NC_008309  72350  72655  306  30S ribosomal protein S14  YP_718279  hitchhiker  1.36211e-06  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0074  CDS  NC_008309  72692  73084  393  30S ribosomal protein S8  YP_718280  hitchhiker  5.74269e-05  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0075  CDS  NC_008309  73101  73634  534  50S ribosomal protein L6  YP_718281  normal  0.0536854  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0076  CDS  NC_008309  73648  74001  354  50S ribosomal protein L18  YP_718282  normal  0.0482673  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0077  CDS  NC_008309  74017  74517  501  30S ribosomal protein S5  YP_718283  normal  0.0793538  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0078  CDS  NC_008309  74521  74703  183  50S ribosomal protein L30  YP_718284  normal  0.0903493  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0079  CDS  NC_008309  74708  75142  435  50S ribosomal protein L15  YP_718285  normal  0.213113  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0080  CDS  NC_008309  75150  76475  1326  preprotein translocase subunit SecY  YP_718286  normal  0.0404503  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0080a  CDS  NC_008309  76503  76616  114  50S ribosomal protein L36  YP_718287  hitchhiker  4.00492e-05  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0081  CDS  NC_008309  76760  77116  357  30S ribosomal protein S13  YP_718288  hitchhiker  2.27347e-06  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0082  CDS  NC_008309  77132  77521  390  30S ribosomal protein S11  YP_718289  decreased coverage  6.25128e-08  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0083  CDS  NC_008309  77551  78171  621  30S ribosomal protein S4  YP_718290  decreased coverage  3.23728e-07  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0084  CDS  NC_008309  78204  79193  990  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  YP_718291  hitchhiker  2.68564e-05  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0085  CDS  NC_008309  79235  79621  387  50S ribosomal protein L17  YP_718292  hitchhiker  1.3942e-05  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0086  CDS  NC_008309  79692  80378  687  hypothetical protein  YP_718293  hitchhiker  0.00135012  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0087  CDS  NC_008309  80383  81660  1278  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  YP_718294  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0088  CDS  NC_008309  81736  82026  291  hypothetical protein  YP_718295  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0089  CDS  NC_008309  82323  82961  639  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  YP_718296  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0090  CDS  NC_008309  83118  83783  666  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  YP_718297  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0091  CDS  NC_008309  83783  84595  813  phosphomethylpyrimidine kinase  YP_718298  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0092  CDS  NC_008309  84588  85388  801  hydroxyethylthiazole kinase  YP_718299  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0093  CDS  NC_008309  85961  86569  609  DNA repair protein RecO  YP_718300  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0094  CDS  NC_008309  86590  87909  1320  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  YP_718301  normal  0.146255  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0095  CDS  NC_008309  87921  90158  2238  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  YP_718302  unclonable  0.000291848  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0096  CDS  NC_008309  90183  90539  357  diacylglycerol kinase  YP_718303  normal  0.960764  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0097    NC_008309  90586  92524  1939      normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0099  CDS  NC_008309  92709  92966  258  hypothetical protein  YP_718304  normal  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>