51 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
HY04AAS1_0054  CDS  NC_011126  48367  49437  -  1071  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  YP_002120724  unclonable  0.000000000000250606  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0103  CDS  NC_011126  96036  97595  +  1560  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  YP_002120773  unclonable  0.0000000000150576  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0132  CDS  NC_011126  118794  119132  -  339  nitrogen regulatory protein P-II  YP_002120802  unclonable  0.00000000000000199717  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0186  CDS  NC_011126  165861  166052  -  192  transcriptional antiterminator, BglG  YP_002120856  unclonable  0.0000000000000024901  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0187  CDS  NC_011126  166140  166517  -  378  hypothetical protein  YP_002120857  unclonable  0.00000000000000751184  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0253  CDS  NC_011126  224187  224924  +  738  NusG antitermination factor  YP_002120921  unclonable  0.000000000000116635  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0254  CDS  NC_011126  224935  225372  +  438  50S ribosomal protein L11  YP_002120922  unclonable  0.0000000000000149943  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0260  CDS  NC_011126  236341  236748  +  408  30S ribosomal protein S12  YP_002120928  unclonable  0.0000000000000200867  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0275  CDS  NC_011126  245845  246210  +  366  50S ribosomal protein L14  YP_002120943  unclonable  0.00000000000000428064  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0287  CDS  NC_011126  251827  252600  +  774  methionine aminopeptidase, type I  YP_002120955  unclonable  0.0000000000000363229  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0288  CDS  NC_011126  252602  252844  +  243  translation initiation factor IF-1  YP_002120956  unclonable  0.00000000000000107247  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0289  CDS  NC_011126  252854  252967  +  114  ribosomal protein L36  YP_002120957  unclonable  4.62447e-16  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0290  CDS  NC_011126  252982  253362  +  381  30S ribosomal protein S13  YP_002120958  unclonable  0.00000000000000353572  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0291  CDS  NC_011126  253375  253767  +  393  30S ribosomal protein S11  YP_002120959  unclonable  0.00000000000000693018  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0307  CDS  NC_011126  265542  268358  +  2817  molybdopterin oxidoreductase  YP_002120975  unclonable  0.0000000512628  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0319  CDS  NC_011126  278070  279551  -  1482  hypothetical protein  YP_002120987  unclonable  0.00000000000684718  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0339  CDS  NC_011126  297010  298656  +  1647  Hydroxylamine reductase  YP_002121007  unclonable  0.0000000000373839  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0352  CDS  NC_011126  310247  311593  +  1347  hypothetical protein  YP_002121020  unclonable  0.00000000000257502  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0450  CDS  NC_011126  392645  393103  -  459  single-strand binding protein  YP_002121118  unclonable  0.0000000000000062046  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0619  CDS  NC_011126  552746  554767  +  2022  TonB-dependent receptor  YP_002121284  unclonable  0.000000000412727  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0644  CDS  NC_011126  578310  579041  +  732  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  YP_002121309  unclonable  0.0000000000000386152  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0680  CDS  NC_011126  610872  612188  -  1317  tRNA modification GTPase TrmE  YP_002121345  unclonable  0.00000000000180906  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0718  CDS  NC_011126  653955  656009  +  2055  K+-transporting ATPase, B subunit  YP_002121383  unclonable  0.000000000220331  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0735  CDS  NC_011126  670248  670685  +  438  heat shock protein Hsp20  YP_002121400  unclonable  0.0000000000000037192  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0743  CDS  NC_011126  676669  677175  +  507  histidine triad (HIT) protein  YP_002121408  unclonable  0.0000000000000120261  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0744  CDS  NC_011126  677218  677421  +  204  30S ribosomal protein S21  YP_002121409  unclonable  9.79578e-16  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0794  CDS  NC_011126  734922  736343  -  1422  Carbohydrate-selective porin OprB  YP_002121459  unclonable  0.00000000000421873  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0795  CDS  NC_011126  736560  738059  -  1500  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  YP_002121460  unclonable  0.00000000000774883  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0798  CDS  NC_011126  739728  740498  +  771  TraT complement resistance family protein  YP_002121463  unclonable  0.0000000000000491779  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0823  CDS  NC_011126  764311  765729  -  1419  Cytochrome-c oxidase  YP_002121488  unclonable  0.0000000000043936  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0824  CDS  NC_011126  765742  766632  -  891  cytochrome c class I  YP_002121489  unclonable  0.0000000000000780419  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0927  CDS  NC_011126  874553  875404  -  852  tRNA pseudouridine synthase B  YP_002121592  unclonable  0.000000000000224094  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0936  CDS  NC_011126  881696  882997  +  1302  ammonium transporter  YP_002121601  unclonable  0.00000000000377465  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0937  CDS  NC_011126  883019  884164  +  1146  hypothetical protein  YP_002121602  unclonable  0.00000000000117538  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0938  CDS  NC_011126  884197  884328  +  132  putative diguanylate phosphodiesterase  YP_002121603  unclonable  0.00000000000000116247  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0939  CDS  NC_011126  884469  885818  +  1350  hypothetical protein  YP_002121604  unclonable  0.00000000000462454  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0960  CDS  NC_011126  900156  901493  +  1338  hypothetical protein  YP_002121625  unclonable  0.00000000000766698  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0966  CDS  NC_011126  904765  905385  -  621  MotA/TolQ/ExbB proton channel  YP_002121631  unclonable  0.0000000000000271628  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0984  CDS  NC_011126  921448  922185  +  738  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  YP_002121648  unclonable  0.0000000000000619324  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1007  CDS  NC_011126  942311  942745  -  435  ribosomal protein L13  YP_002121671  unclonable  0.0000000000000149943  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1051  CDS  NC_011126  981959  982228  +  270  histone family protein DNA-binding protein  YP_002121715  unclonable  0.00000000000000497636  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1052  CDS  NC_011126  982287  982739  +  453  hypothetical protein  YP_002121716  unclonable  0.0000000000000203128  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1261  CDS  NC_011126  1167353  1168873  +  1521  hypothetical protein  YP_002121924  unclonable  0.0000000000214476  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1359  CDS  NC_011126  1272330  1273739  +  1410  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  YP_002122022  unclonable  0.0000000000049629  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1403  CDS  NC_011126  1317147  1319024  -  1878  molecular chaperone DnaK  YP_002122066  unclonable  0.000000000203004  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1508  CDS  NC_011126  1422974  1423195  -  222  hypothetical protein  YP_002122169  unclonable  0.00000000000000131146  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1533  CDS  NC_011126  1449410  1449961  +  552  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  YP_002122194  unclonable  0.0000000000000181643  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1583  CDS  NC_011126  1500292  1502709  -  2418  phosphoenolpyruvate synthase  YP_002122242  unclonable  0.00000000580674  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1614  CDS  NC_011126  1534243  1535238  +  996  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  YP_002122273  unclonable  0.000000000000235869  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1615  CDS  NC_011126  1535226  1536122  +  897  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  YP_002122274  unclonable  0.000000000000131585  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1630  CDS  NC_011126  1549626  1550447  -  822  hypothetical protein  YP_002122289  unclonable  0.000000000000164262  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>