More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0288 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0288  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 80 aa  164  5e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107247  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0268  translation initiation factor IF-1  74.24 
 
 		 78 aa  111  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  70.59 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1168  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 		 71 aa  107  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143107  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 73 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  70.59 
 
 		 72 aa  105  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 75 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 75 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 74 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0168  translation initiation factor IF-1  66.18 
 
 		 73 aa  104  3e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000112845  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0421  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 		 74 aa  105  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  66.18 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  63.77 
 
 		 73 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  63.77 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1916  translation initiation factor IF-1  68.12 
 
 		 72 aa  104  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1845  translation initiation factor IF-1  55.7 
 
 		 99 aa  103  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  64.71 
 
 		 73 aa  104  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0376  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 71 aa  104  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 73 aa  103  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 75 aa  103  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  65.22 
 
 		 72 aa  103  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 74 aa  103  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 74 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0864  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.177716  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2992  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 74 aa  103  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 72 aa  103  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  60.87 
 
 		 73 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0713  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 72 aa  103  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  65.22 
 
 		 73 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  66.18 
 
 		 73 aa  103  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  66.18 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  66.18 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  60.87 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  60.87 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2087  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000107784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4365  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.304596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3259  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.015028  hitchhiker  0.0000000000497253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3723  translation initiation factor IF-1  70.97 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0976  translation initiation factor IF-1  70.59 
 
 		 74 aa  101  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.844523  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  65.22 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  65.22 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1115  translation initiation factor IF-1  70.59 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000159264  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 73 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3140  translation initiation factor IF-1  63.77 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.222249  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  66.18 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  66.18 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 73 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5765  translation initiation factor IF-1  66.18 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.959499 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 72 aa  100  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  66.18 
 
 		 72 aa  100  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  63.24 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1371  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 		 74 aa  100  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  63.24 
 
 		 72 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1315  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 		 74 aa  100  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000270736  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  60.87 
 
 		 73 aa  100  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 72 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3900  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  68.75 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1261  translation initiation factor IF-1  66.18 
 
 		 72 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  66.18 
 
 		 83 aa  100  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4291  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 73 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.525945  hitchhiker  0.00108968 
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  60.29 
 
 		 73 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  62.32 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0609  translation initiation factor IF-1  63.77 
 
 		 73 aa  100  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2692  translation initiation factor IF-1  68.12 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0849354  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0605  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 73 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0700  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0071  translation initiation factor IF-1  60.87 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358943  hitchhiker  0.000000000845588 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1932  translation initiation factor IF-1  65.22 
 
 		 74 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000750543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2659  translation initiation factor IF-1  63.77 
 
 		 73 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6026  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 73 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2944  translation initiation factor IF-1  63.77 
 
 		 73 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  60.29 
 
 		 73 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  64.71 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  63.77 
 
 		 73 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  60.29 
 
 		 73 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1399  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0788  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  63.77 
 
 		 72 aa  98.6  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1409  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0978791  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2598  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000268171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 73 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252323  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1569  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.471735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  62.32 
 
 		 73 aa  98.6  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>