More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1916 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1916  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  150  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0376  translation initiation factor IF-1  78.87 
 
 
71 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3140  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.222249  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05825  translation initiation factor IF-1  80.28 
 
 
71 aa  128  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1168  translation initiation factor IF-1  80.28 
 
 
71 aa  129  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4365  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.304596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5765  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.959499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1637  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  116  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  69.44 
 
 
85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  113  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0307  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  70.83 
 
 
72 aa  113  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1762  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  72.22 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1944  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.25939  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1578  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
73 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0864  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  110  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.177716  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  110  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0209  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310182  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1947  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  70 
 
 
73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  63.89 
 
 
73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2207  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268658  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0090  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.146045  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1012  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252323  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2401  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000518496  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2087  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000107784  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 
73 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1755  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0524428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0055  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
75 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000117845  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1446  translation initiation factor 1  62.5 
 
 
72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.43996  normal  0.245774 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  107  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 
73 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0322  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  107  5e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0381418  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 
83 aa  107  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
75 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
75 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
73 aa  107  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
73 aa  107  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  62.5 
 
 
73 aa  107  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  65.28 
 
 
72 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00895  hypothetical protein  65.28 
 
 
72 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.220909  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1068  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>