More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0729 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  148  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 
73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 
72 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 
72 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  124  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  124  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  124  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
75 aa  124  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  124  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  123  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  123  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  123  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  80.56 
 
 
72 aa  123  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  80.56 
 
 
72 aa  121  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  76.39 
 
 
72 aa  120  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  120  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 
73 aa  120  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  75 
 
 
85 aa  120  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  118  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  117  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  117  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 
83 aa  117  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  117  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  75.34 
 
 
73 aa  116  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  116  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  73.61 
 
 
73 aa  116  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
73 aa  115  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  72.22 
 
 
73 aa  115  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
73 aa  115  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000405996  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0168  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
73 aa  116  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000112845  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  70.83 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  115  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1446  translation initiation factor 1  73.61 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.43996  normal  0.245774 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
73 aa  114  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  72.6 
 
 
73 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 
73 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  114  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310182  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  75 
 
 
72 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0788  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0427715  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3900  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 
153 aa  114  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0609  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 
73 aa  114  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398848  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 
73 aa  113  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4291  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 
73 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.525945  hitchhiker  0.00108968 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252323  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2087  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000107784  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2929  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204255 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  70.42 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0268  translation initiation factor IF-1  78.46 
 
 
78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  71.23 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4484  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 
73 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75714  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1762  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0713  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
73 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  70 
 
 
73 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1944  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.25939  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0421  translation initiation factor IF-1  73.24 
 
 
74 aa  111  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1578  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1916  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  70 
 
 
74 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5765  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.959499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>