More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0229 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
75 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
75 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  94.59 
 
 
74 aa  144  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  94.59 
 
 
74 aa  144  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2992  translation initiation factor IF-1  94.59 
 
 
74 aa  144  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  91.89 
 
 
74 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3723  translation initiation factor IF-1  94.03 
 
 
67 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  79.17 
 
 
73 aa  126  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  76.39 
 
 
85 aa  122  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  120  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  120  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  120  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  72 
 
 
75 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
73 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3352  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0756524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4007  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.676038  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3612  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242621  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2588  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2392  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3182  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142859  normal  0.0830693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3589  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3411  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.209503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28260  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30240  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1826  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904504  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  117  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  116  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  116  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1790  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 
72 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  115  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
78 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
78 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000744837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  72.22 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  69.44 
 
 
87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
73 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2139  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1756  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
73 aa  114  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3259  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.015028  hitchhiker  0.0000000000497253 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2439  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  113  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000433006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0080  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000359666  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1734  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 
73 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1734  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 
73 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1885  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000423872  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>